Protein–RNA interactions for Protein: P35177

SPT7, Transcriptional activator SPT7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT7P35177 YMR210WYMR210W 1350 nt10.79□□□□□ -0.68
SPT7P35177 LEA1YPL213W 717 nt10.78□□□□□ -0.68
SPT7P35177 YBR056WYBR056W 1506 nt10.77□□□□□ -0.68
SPT7P35177 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.77□□□□□ -0.69
SPT7P35177 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.77□□□□□ -0.69
SPT7P35177 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.77□□□□□ -0.69
SPT7P35177 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.77□□□□□ -0.69
SPT7P35177 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.77□□□□□ -0.69
SPT7P35177 YMR206WYMR206W 942 nt10.77□□□□□ -0.69
SPT7P35177 ORT1YOR130C 879 nt10.77□□□□□ -0.69
SPT7P35177 SDH8YBR269C 417 nt10.76□□□□□ -0.69
SPT7P35177 snR4snR4 186 nt10.76□□□□□ -0.69
SPT7P35177 EDC2YER035W 438 nt10.75□□□□□ -0.69
SPT7P35177 YJR149WYJR149W 1215 nt10.73□□□□□ -0.69
SPT7P35177 YFR020WYFR020W 699 nt10.72□□□□□ -0.69
SPT7P35177 YJL009WYJL009W 327 nt10.72□□□□□ -0.69
SPT7P35177 DUS3YLR401C 2007 nt10.71□□□□□ -0.69
SPT7P35177 GAL2YLR081W 1725 nt10.71□□□□□ -0.69
SPT7P35177 HIS3YOR202W 663 nt10.71□□□□□ -0.69
SPT7P35177 TOK1YJL093C 2076 nt10.71□□□□□ -0.7
SPT7P35177 MDL2YPL270W 2322 nt10.7□□□□□ -0.7
SPT7P35177 MRP1YDR347W 966 nt10.7□□□□□ -0.7
SPT7P35177 ENO1YGR254W 1314 nt10.69□□□□□ -0.7
SPT7P35177 YGR210CYGR210C 1236 nt10.68□□□□□ -0.7
SPT7P35177 KAE1YKR038C 1161 nt10.67□□□□□ -0.7
SPT7P35177 RSM7YJR113C 744 nt10.66□□□□□ -0.7
SPT7P35177 SRP102YKL154W 735 nt10.66□□□□□ -0.7
SPT7P35177 RNA170RNA170 169 nt10.66□□□□□ -0.7
SPT7P35177 BSP1YPR171W 1731 nt10.66□□□□□ -0.7
SPT7P35177 PRE5YMR314W 705 nt10.65□□□□□ -0.7
SPT7P35177 BUB2YMR055C 921 nt10.64□□□□□ -0.71
SPT7P35177 ERO1YML130C 1692 nt10.63□□□□□ -0.71
SPT7P35177 YLR280CYLR280C 351 nt10.6□□□□□ -0.71
SPT7P35177 MRN1YPL184C 1839 nt10.6□□□□□ -0.71
SPT7P35177 YRF1-2YER190W 5046 nt10.6□□□□□ -0.71
SPT7P35177 BAP3YDR046C 1815 nt10.59□□□□□ -0.71
SPT7P35177 YIR035CYIR035C 765 nt10.59□□□□□ -0.71
SPT7P35177 INO1YJL153C 1602 nt10.59□□□□□ -0.71
SPT7P35177 LRO1YNR008W 1986 nt10.59□□□□□ -0.71
SPT7P35177 MET22YOL064C 1074 nt10.58□□□□□ -0.71
SPT7P35177 DIP5YPL265W 1827 nt10.58□□□□□ -0.72
SPT7P35177 BUD31YCR063W 474 nt10.57□□□□□ -0.72
SPT7P35177 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT7P35177 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT7P35177 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT7P35177 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT7P35177 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT7P35177 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT7P35177 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT7P35177 YPL247CYPL247C 1572 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT7P35177 YPL108WYPL108W 507 nt10.55□□□□□ -0.72
SPT7P35177 EHT1YBR177C 1356 nt10.54□□□□□ -0.72
SPT7P35177 DIA4YHR011W 1341 nt10.54□□□□□ -0.72
SPT7P35177 YJL160CYJL160C 864 nt10.54□□□□□ -0.72
SPT7P35177 SHC1YER096W 1539 nt10.53□□□□□ -0.72
SPT7P35177 FIT1YDR534C 1587 nt10.52□□□□□ -0.72
SPT7P35177 GDH1YOR375C 1365 nt10.52□□□□□ -0.73
SPT7P35177 GLY1YEL046C 1164 nt10.51□□□□□ -0.73
SPT7P35177 WSC4YHL028W 1818 nt10.51□□□□□ -0.73
SPT7P35177 NDE2YDL085W 1638 nt10.5□□□□□ -0.73
SPT7P35177 ADE16YLR028C 1776 nt10.49□□□□□ -0.73
SPT7P35177 PDC6YGR087C 1692 nt10.49□□□□□ -0.73
SPT7P35177 OCH1YGL038C 1443 nt10.48□□□□□ -0.73
SPT7P35177 TIF3YPR163C 1311 nt10.47□□□□□ -0.73
SPT7P35177 ALG7YBR243C 1347 nt10.47□□□□□ -0.73
SPT7P35177 ARO3YDR035W 1113 nt10.47□□□□□ -0.73
SPT7P35177 YLR460CYLR460C 1131 nt10.47□□□□□ -0.73
SPT7P35177 CHS7YHR142W 951 nt10.46□□□□□ -0.73
SPT7P35177 TGL5YOR081C 2250 nt10.45□□□□□ -0.74
SPT7P35177 YNL140CYNL140C 570 nt10.45□□□□□ -0.74
SPT7P35177 HXT8YJL214W 1710 nt10.44□□□□□ -0.74
SPT7P35177 UFD1YGR048W 1086 nt10.44□□□□□ -0.74
SPT7P35177 CAK1YFL029C 1107 nt10.43□□□□□ -0.74
SPT7P35177 RHO1YPR165W 630 nt10.43□□□□□ -0.74
SPT7P35177 HSV2YGR223C 1347 nt10.43□□□□□ -0.74
SPT7P35177 INM1YHR046C 888 nt10.42□□□□□ -0.74
SPT7P35177 PMT7YDR307W 1989 nt10.42□□□□□ -0.74
SPT7P35177 YMR166CYMR166C 1107 nt10.41□□□□□ -0.74
SPT7P35177 MDH2YOL126C 1134 nt10.41□□□□□ -0.74
SPT7P35177 MFT1YML062C 1179 nt10.4□□□□□ -0.74
SPT7P35177 ELP6YMR312W 822 nt10.4□□□□□ -0.74
SPT7P35177 OLA1YBR025C 1185 nt10.4□□□□□ -0.74
SPT7P35177 PFS2YNL317W 1398 nt10.4□□□□□ -0.75
SPT7P35177 MET13YGL125W 1803 nt10.39□□□□□ -0.75
SPT7P35177 PET18YCR020C 648 nt10.39□□□□□ -0.75
SPT7P35177 TAD2YJL035C 753 nt10.39□□□□□ -0.75
SPT7P35177 TDA4YJR116W 840 nt10.39□□□□□ -0.75
SPT7P35177 TPO1YLL028W 1761 nt10.39□□□□□ -0.75
SPT7P35177 LSP1YPL004C 1026 nt10.38□□□□□ -0.75
SPT7P35177 ADA2YDR448W 1305 nt10.38□□□□□ -0.75
SPT7P35177 THI73YLR004C 1572 nt10.38□□□□□ -0.75
SPT7P35177 PUP3YER094C 618 nt10.37□□□□□ -0.75
SPT7P35177 MRP7YNL005C 1116 nt10.37□□□□□ -0.75
SPT7P35177 RCF1YML030W 480 nt10.36□□□□□ -0.75
SPT7P35177 PMT1YDL095W 2454 nt10.36□□□□□ -0.75
SPT7P35177 MTC6YHR151C 1581 nt10.34□□□□□ -0.75
SPT7P35177 PET494YNR045W 1470 nt10.34□□□□□ -0.75
SPT7P35177 COS10YNR075W 1125 nt10.33□□□□□ -0.76
SPT7P35177 KTR4YBR199W 1395 nt10.32□□□□□ -0.76
SPT7P35177 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 118.1 ms