Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms