Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms