Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms