Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMB2P55268 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB2P55268 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms