Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE2O96020 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms