Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms