Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms