Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms