Protein–RNA interactions for Protein: Q12481

RRP36, rRNA biogenesis protein RRP36, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP36	Q12481	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
RRP36	Q12481	RPL39	YJL189W	156 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
RRP36	Q12481	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RRP36	Q12481	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RRP36	Q12481	YKL118W	YKL118W	312 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RRP36	Q12481	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
RRP36	Q12481	RDS3	YPR094W	324 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RRP36	Q12481	snR39B	snR39B	96 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RRP36	Q12481	snR161	snR161	161 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
RRP36	Q12481	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
RRP36	Q12481	YER181C	YER181C	324 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
RRP36	Q12481	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
RRP36	Q12481	snR55	snR55	98 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
RRP36	Q12481	JLP2	YMR132C	627 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
RRP36	Q12481	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
RRP36	Q12481	YPR012W	YPR012W	255 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
RRP36	Q12481	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
RRP36	Q12481	GIM4	YEL003W	336 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
RRP36	Q12481	snR67	snR67	82 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RRP36	Q12481	Q0144	Q0144	330 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RRP36	Q12481	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
RRP36	Q12481	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
RRP36	Q12481	YBR178W	YBR178W	375 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
RRP36	Q12481	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
RRP36	Q12481	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
RRP36	Q12481	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
RRP36	Q12481	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
RRP36	Q12481	YOR302W	YOR302W	78 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
RRP36	Q12481	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
RRP36	Q12481	YNL205C	YNL205C	423 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
RRP36	Q12481	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
RRP36	Q12481	snR52	snR52	92 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
RRP36	Q12481	snR65	snR65	100 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
RRP36	Q12481	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
RRP36	Q12481	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
RRP36	Q12481	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
RRP36	Q12481	snR48	snR48	113 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
RRP36	Q12481	YOR102W	YOR102W	351 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
RRP36	Q12481	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
RRP36	Q12481	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
RRP36	Q12481	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
RRP36	Q12481	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
RRP36	Q12481	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
RRP36	Q12481	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
RRP36	Q12481	snR80	snR80	171 nt		-1.54	□□□□□ -2.66
RRP36	Q12481	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-1.54	□□□□□ -2.66
RRP36	Q12481	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
RRP36	Q12481	snR56	snR56	88 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
RRP36	Q12481	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
RRP36	Q12481	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
RRP36	Q12481	snR77	snR77	88 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
RRP36	Q12481	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
RRP36	Q12481	YNL198C	YNL198C	303 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
RRP36	Q12481	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
RRP36	Q12481	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
RRP36	Q12481	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
RRP36	Q12481	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
RRP36	Q12481	YBL053W	YBL053W	375 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
RRP36	Q12481	snR81	snR81	201 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
RRP36	Q12481	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
RRP36	Q12481	YJL150W	YJL150W	303 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
RRP36	Q12481	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
RRP36	Q12481	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
RRP36	Q12481	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
RRP36	Q12481	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-2	□□□□□ -2.73
RRP36	Q12481	RPL41A	YDL184C	78 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
RRP36	Q12481	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
RRP36	Q12481	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
RRP36	Q12481	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-2.06	□□□□□ -2.74
RRP36	Q12481	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
RRP36	Q12481	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.09	□□□□□ -2.74
RRP36	Q12481	YGR151C	YGR151C	336 nt		-2.12	□□□□□ -2.75
RRP36	Q12481	snR38	snR38	95 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
RRP36	Q12481	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-2.18	□□□□□ -2.76
RRP36	Q12481	SPG3	YDR504C	384 nt		-2.21	□□□□□ -2.76
RRP36	Q12481	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-2.21	□□□□□ -2.76
RRP36	Q12481	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-2.24	□□□□□ -2.77
RRP36	Q12481	snR47	snR47	99 nt		-2.27	□□□□□ -2.77
RRP36	Q12481	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-2.28	□□□□□ -2.77
RRP36	Q12481	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-2.36	□□□□□ -2.79
RRP36	Q12481	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-2.4	□□□□□ -2.79
RRP36	Q12481	snR6	snR6	112 nt		-2.42	□□□□□ -2.8
RRP36	Q12481	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-2.44	□□□□□ -2.8
RRP36	Q12481	YNL338W	YNL338W	159 nt		-2.48	□□□□□ -2.81
RRP36	Q12481	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-2.48	□□□□□ -2.81
RRP36	Q12481	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-2.51	□□□□□ -2.81
RRP36	Q12481	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-2.53	□□□□□ -2.81
RRP36	Q12481	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-2.56	□□□□□ -2.82
RRP36	Q12481	Q0142	Q0142	177 nt		-2.56	□□□□□ -2.82
RRP36	Q12481	snR73	snR73	106 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
RRP36	Q12481	YNL337W	YNL337W	255 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
RRP36	Q12481	YKL225W	YKL225W	348 nt		-2.58	□□□□□ -2.82
RRP36	Q12481	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-2.66	□□□□□ -2.84
RRP36	Q12481	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.66	□□□□□ -2.84
RRP36	Q12481	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-2.72	□□□□□ -2.84
RRP36	Q12481	snR85	snR85	171 nt		-2.79	□□□□□ -2.86
RRP36	Q12481	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
RRP36	Q12481	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-2.87	□□□□□ -2.87
RRP36	Q12481	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-2.87	□□□□□ -2.87
RRP36	Q12481	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-2.91	□□□□□ -2.88

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54 ms