Protein–RNA interactions for Protein: Q12466

TCB1, Tricalbin-1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TCB1Q12466 IML1YJR138W 4755 nt1.85□□□□□ -2.11
TCB1Q12466 MSN5YDR335W 3675 nt1.83□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 SWI4YER111C 3282 nt1.8□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.78□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.78□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.78□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.78□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.78□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.78□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.78□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 PAU12YGR294W 363 nt1.78□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 PAU24YBR301W 363 nt1.78□□□□□ -2.12
TCB1Q12466 NUP145YGL092W 3954 nt1.75□□□□□ -2.13
TCB1Q12466 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.75□□□□□ -2.13
TCB1Q12466 TRM732YMR259C 4263 nt1.73□□□□□ -2.13
TCB1Q12466 IRA1YBR140C 9279 nt1.72□□□□□ -2.13
TCB1Q12466 MON2YNL297C 4911 nt1.72□□□□□ -2.13
TCB1Q12466 SIP4YJL089W 2490 nt1.71□□□□□ -2.14
TCB1Q12466 PET111YMR257C 2403 nt1.7□□□□□ -2.14
TCB1Q12466 BUL2YML111W 2763 nt1.69□□□□□ -2.14
TCB1Q12466 HKR1YDR420W 5409 nt1.69□□□□□ -2.14
TCB1Q12466 CLU1YMR012W 3834 nt1.68□□□□□ -2.14
TCB1Q12466 BST1YFL025C 3090 nt1.68□□□□□ -2.14
TCB1Q12466 EST2YLR318W 2655 nt1.67□□□□□ -2.14
TCB1Q12466 NUP188YML103C 4968 nt1.65□□□□□ -2.15
TCB1Q12466 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.65□□□□□ -2.15
TCB1Q12466 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.65□□□□□ -2.15
TCB1Q12466 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.64□□□□□ -2.15
TCB1Q12466 CDC39YCR093W 6327 nt1.63□□□□□ -2.15
TCB1Q12466 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.63□□□□□ -2.15
TCB1Q12466 FYV8YGR196C 2454 nt1.62□□□□□ -2.15
TCB1Q12466 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.55□□□□□ -2.16
TCB1Q12466 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.52□□□□□ -2.17
TCB1Q12466 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.47□□□□□ -2.17
TCB1Q12466 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.47□□□□□ -2.17
TCB1Q12466 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.47□□□□□ -2.17
TCB1Q12466 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.47□□□□□ -2.17
TCB1Q12466 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.47□□□□□ -2.17
TCB1Q12466 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.47□□□□□ -2.17
TCB1Q12466 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.47□□□□□ -2.17
TCB1Q12466 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.47□□□□□ -2.17
TCB1Q12466 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.46□□□□□ -2.18
TCB1Q12466 snR67snR67 82 nt1.42□□□□□ -2.18
TCB1Q12466 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.4□□□□□ -2.19
TCB1Q12466 SPT7YBR081C 3999 nt1.39□□□□□ -2.19
TCB1Q12466 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.38□□□□□ -2.19
TCB1Q12466 UTP20YBL004W 7482 nt1.38□□□□□ -2.19
TCB1Q12466 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.38□□□□□ -2.19
TCB1Q12466 MLP2YIL149C 5040 nt1.36□□□□□ -2.19
TCB1Q12466 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.32□□□□□ -2.2
TCB1Q12466 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.32□□□□□ -2.2
TCB1Q12466 VAM6YDL077C 3150 nt1.31□□□□□ -2.2
TCB1Q12466 BUD3YCL014W 4911 nt1.3□□□□□ -2.2
TCB1Q12466 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.26□□□□□ -2.21
TCB1Q12466 YMR160WYMR160W 2451 nt1.26□□□□□ -2.21
TCB1Q12466 YPR117WYPR117W 7470 nt1.25□□□□□ -2.21
TCB1Q12466 YOL014WYOL014W 375 nt1.24□□□□□ -2.21
TCB1Q12466 RKR1YMR247C 4689 nt1.21□□□□□ -2.22
TCB1Q12466 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TCB1Q12466 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TCB1Q12466 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TCB1Q12466 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TCB1Q12466 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TCB1Q12466 snR40snR40 97 nt1.18□□□□□ -2.22
TCB1Q12466 MYO1YHR023W 5787 nt1.18□□□□□ -2.22
TCB1Q12466 DOP1YDR141C 5097 nt1.17□□□□□ -2.22
TCB1Q12466 BEM2YER155C 6504 nt1.13□□□□□ -2.23
TCB1Q12466 SCC2YDR180W 4482 nt1.1□□□□□ -2.23
TCB1Q12466 LTE1YAL024C 4308 nt1.09□□□□□ -2.23
TCB1Q12466 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.07□□□□□ -2.24
TCB1Q12466 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.07□□□□□ -2.24
TCB1Q12466 YJR029WYJR029W 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
TCB1Q12466 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
TCB1Q12466 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.98□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 snR77snR77 88 nt0.97□□□□□ -2.25
TCB1Q12466 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.93□□□□□ -2.26
TCB1Q12466 MLP1YKR095W 5628 nt0.92□□□□□ -2.26
TCB1Q12466 SBH2YER019C-A 267 nt0.88□□□□□ -2.27
TCB1Q12466 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.84□□□□□ -2.27
TCB1Q12466 FMP27YLR454W 7887 nt0.84□□□□□ -2.28
TCB1Q12466 IQG1YPL242C 4488 nt0.8□□□□□ -2.28
TCB1Q12466 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.79□□□□□ -2.28
TCB1Q12466 SOV1YMR066W 2697 nt0.78□□□□□ -2.28
TCB1Q12466 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
TCB1Q12466 ESP1YGR098C 4893 nt0.68□□□□□ -2.3
TCB1Q12466 THO2YNL139C 4794 nt0.67□□□□□ -2.3
TCB1Q12466 UTP10YJL109C 5310 nt0.65□□□□□ -2.31
TCB1Q12466 PAU9YBL108C-A 129 nt0.6□□□□□ -2.31
TCB1Q12466 YJL113WYJL113W 4647 nt0.57□□□□□ -2.32
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