Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 LAA1YJL207C 6045 nt1.34□□□□□ -2.19
LPX1Q12405 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.34□□□□□ -2.19
LPX1Q12405 RPL41AYDL184C 78 nt1.34□□□□□ -2.19
LPX1Q12405 SSK2YNR031C 4740 nt1.34□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 CCH1YGR217W 6120 nt1.34□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.33□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 CDC39YCR093W 6327 nt1.33□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.32□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 HKR1YDR420W 5409 nt1.31□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 NIP1YMR309C 2439 nt1.3□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 IML1YJR138W 4755 nt1.3□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 SIP4YJL089W 2490 nt1.29□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 PAU12YGR294W 363 nt1.28□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.28□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.28□□□□□ -2.2
LPX1Q12405 BUL2YML111W 2763 nt1.27□□□□□ -2.21
LPX1Q12405 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.26□□□□□ -2.21
LPX1Q12405 SPT7YBR081C 3999 nt1.25□□□□□ -2.21
LPX1Q12405 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.23□□□□□ -2.21
LPX1Q12405 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.23□□□□□ -2.21
LPX1Q12405 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.23□□□□□ -2.21
LPX1Q12405 SKI7YOR076C 2244 nt1.23□□□□□ -2.21
LPX1Q12405 snR38snR38 95 nt1.22□□□□□ -2.21
LPX1Q12405 CLU1YMR012W 3834 nt1.21□□□□□ -2.22
LPX1Q12405 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.21□□□□□ -2.22
LPX1Q12405 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.19□□□□□ -2.22
LPX1Q12405 AI1Q0050 2505 nt1.18□□□□□ -2.22
LPX1Q12405 NST1YNL091W 3723 nt1.18□□□□□ -2.22
LPX1Q12405 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.15□□□□□ -2.23
LPX1Q12405 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.14□□□□□ -2.23
LPX1Q12405 BUD3YCL014W 4911 nt1.14□□□□□ -2.23
LPX1Q12405 MYO1YHR023W 5787 nt1.12□□□□□ -2.23
LPX1Q12405 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.11□□□□□ -2.23
LPX1Q12405 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.1□□□□□ -2.23
LPX1Q12405 snR75snR75 89 nt1.1□□□□□ -2.23
LPX1Q12405 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.09□□□□□ -2.23
LPX1Q12405 RKR1YMR247C 4689 nt1.09□□□□□ -2.24
LPX1Q12405 YJR029WYJR029W 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
LPX1Q12405 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
LPX1Q12405 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
LPX1Q12405 DOP1YDR141C 5097 nt1.03□□□□□ -2.24
LPX1Q12405 BEM2YER155C 6504 nt1.01□□□□□ -2.25
LPX1Q12405 SCC2YDR180W 4482 nt1□□□□□ -2.25
LPX1Q12405 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1□□□□□ -2.25
LPX1Q12405 snR67snR67 82 nt0.98□□□□□ -2.25
LPX1Q12405 PET111YMR257C 2403 nt0.97□□□□□ -2.25
LPX1Q12405 YPR117WYPR117W 7470 nt0.95□□□□□ -2.26
LPX1Q12405 LTE1YAL024C 4308 nt0.93□□□□□ -2.26
LPX1Q12405 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
LPX1Q12405 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
LPX1Q12405 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
LPX1Q12405 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.91□□□□□ -2.26
LPX1Q12405 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
LPX1Q12405 PAU24YBR301W 363 nt0.91□□□□□ -2.26
LPX1Q12405 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.85□□□□□ -2.27
LPX1Q12405 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.85□□□□□ -2.27
LPX1Q12405 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.85□□□□□ -2.27
LPX1Q12405 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
LPX1Q12405 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
LPX1Q12405 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.85□□□□□ -2.27
LPX1Q12405 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
LPX1Q12405 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
LPX1Q12405 YMR160WYMR160W 2451 nt0.82□□□□□ -2.28
LPX1Q12405 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.8□□□□□ -2.28
LPX1Q12405 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.79□□□□□ -2.28
LPX1Q12405 MLP1YKR095W 5628 nt0.75□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.75□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 UTP20YBL004W 7482 nt0.75□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 MLP2YIL149C 5040 nt0.73□□□□□ -2.29
LPX1Q12405 YOL014WYOL014W 375 nt0.69□□□□□ -2.3
LPX1Q12405 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.68□□□□□ -2.3
LPX1Q12405 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.67□□□□□ -2.3
LPX1Q12405 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.62□□□□□ -2.31
LPX1Q12405 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
LPX1Q12405 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
LPX1Q12405 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
LPX1Q12405 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.59□□□□□ -2.31
LPX1Q12405 THO2YNL139C 4794 nt0.58□□□□□ -2.32
LPX1Q12405 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.55□□□□□ -2.32
LPX1Q12405 FMP27YLR454W 7887 nt0.54□□□□□ -2.32
LPX1Q12405 IQG1YPL242C 4488 nt0.52□□□□□ -2.33
LPX1Q12405 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.47□□□□□ -2.33
LPX1Q12405 PAU9YBL108C-A 129 nt0.46□□□□□ -2.34
LPX1Q12405 snR77snR77 88 nt0.44□□□□□ -2.34
LPX1Q12405 SOV1YMR066W 2697 nt0.44□□□□□ -2.34
LPX1Q12405 snR128snR128 126 nt0.43□□□□□ -2.34
LPX1Q12405 SBH2YER019C-A 267 nt0.42□□□□□ -2.34
LPX1Q12405 snR40snR40 97 nt0.39□□□□□ -2.35
LPX1Q12405 ESP1YGR098C 4893 nt0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.2 ms