Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.73□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-0.73□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 RDS3YPR094W 324 nt-0.75□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 snR39BsnR39B 96 nt-0.75□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.77□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 snR55snR55 98 nt-0.78□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 YER181CYER181C 324 nt-0.78□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.78□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.78□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 YPR012WYPR012W 255 nt-0.78□□□□□ -2.53
CCW12Q12127 Q0144Q0144 330 nt-0.8□□□□□ -2.54
CCW12Q12127 JLP2YMR132C 627 nt-0.8□□□□□ -2.54
CCW12Q12127 GIM4YEL003W 336 nt-0.81□□□□□ -2.54
CCW12Q12127 snR161snR161 161 nt-0.84□□□□□ -2.54
CCW12Q12127 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.86□□□□□ -2.55
CCW12Q12127 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.86□□□□□ -2.55
CCW12Q12127 YBR178WYBR178W 375 nt-0.86□□□□□ -2.55
CCW12Q12127 snR67snR67 82 nt-0.87□□□□□ -2.55
CCW12Q12127 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.88□□□□□ -2.55
CCW12Q12127 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.89□□□□□ -2.55
CCW12Q12127 YOR302WYOR302W 78 nt-0.89□□□□□ -2.55
CCW12Q12127 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.9□□□□□ -2.55
CCW12Q12127 SKI7YOR076C 2244 nt-0.91□□□□□ -2.55
CCW12Q12127 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.91□□□□□ -2.56
CCW12Q12127 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.93□□□□□ -2.56
CCW12Q12127 YNL205CYNL205C 423 nt-0.94□□□□□ -2.56
CCW12Q12127 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.95□□□□□ -2.56
CCW12Q12127 snR52snR52 92 nt-0.95□□□□□ -2.56
CCW12Q12127 snR65snR65 100 nt-0.98□□□□□ -2.57
CCW12Q12127 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.99□□□□□ -2.57
CCW12Q12127 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.99□□□□□ -2.57
CCW12Q12127 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-1□□□□□ -2.57
CCW12Q12127 snR48snR48 113 nt-1□□□□□ -2.57
CCW12Q12127 YOR102WYOR102W 351 nt-1.01□□□□□ -2.57
CCW12Q12127 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.03□□□□□ -2.57
CCW12Q12127 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.04□□□□□ -2.58
CCW12Q12127 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.05□□□□□ -2.58
CCW12Q12127 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.06□□□□□ -2.58
CCW12Q12127 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.06□□□□□ -2.58
CCW12Q12127 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-1.07□□□□□ -2.58
CCW12Q12127 snR80snR80 171 nt-1.08□□□□□ -2.58
CCW12Q12127 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.09□□□□□ -2.58
CCW12Q12127 snR56snR56 88 nt-1.1□□□□□ -2.59
CCW12Q12127 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.14□□□□□ -2.59
CCW12Q12127 snR77snR77 88 nt-1.15□□□□□ -2.59
CCW12Q12127 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.16□□□□□ -2.6
CCW12Q12127 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.18□□□□□ -2.6
CCW12Q12127 YNL198CYNL198C 303 nt-1.2□□□□□ -2.6
CCW12Q12127 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.22□□□□□ -2.6
CCW12Q12127 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.23□□□□□ -2.61
CCW12Q12127 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.24□□□□□ -2.61
CCW12Q12127 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.24□□□□□ -2.61
CCW12Q12127 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.25□□□□□ -2.61
CCW12Q12127 YBL053WYBL053W 375 nt-1.25□□□□□ -2.61
CCW12Q12127 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.25□□□□□ -2.61
CCW12Q12127 snR81snR81 201 nt-1.27□□□□□ -2.61
CCW12Q12127 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.29□□□□□ -2.62
CCW12Q12127 YJL150WYJL150W 303 nt-1.29□□□□□ -2.62
CCW12Q12127 YNR077CYNR077C 255 nt-1.34□□□□□ -2.62
CCW12Q12127 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.36□□□□□ -2.63
CCW12Q12127 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.4□□□□□ -2.63
CCW12Q12127 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.41□□□□□ -2.64
CCW12Q12127 RPL41AYDL184C 78 nt-1.46□□□□□ -2.64
CCW12Q12127 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.46□□□□□ -2.64
CCW12Q12127 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.48□□□□□ -2.65
CCW12Q12127 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.49□□□□□ -2.65
CCW12Q12127 YGR151CYGR151C 336 nt-1.5□□□□□ -2.65
CCW12Q12127 YOR309CYOR309C 381 nt-1.5□□□□□ -2.65
CCW12Q12127 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.54□□□□□ -2.66
CCW12Q12127 snR38snR38 95 nt-1.54□□□□□ -2.66
CCW12Q12127 SPG3YDR504C 384 nt-1.57□□□□□ -2.66
CCW12Q12127 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.57□□□□□ -2.66
CCW12Q12127 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.59□□□□□ -2.66
CCW12Q12127 snR47snR47 99 nt-1.62□□□□□ -2.67
CCW12Q12127 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.62□□□□□ -2.67
CCW12Q12127 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.69□□□□□ -2.68
CCW12Q12127 snR6snR6 112 nt-1.73□□□□□ -2.69
CCW12Q12127 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.73□□□□□ -2.69
CCW12Q12127 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.73□□□□□ -2.69
CCW12Q12127 YNL338WYNL338W 159 nt-1.75□□□□□ -2.69
CCW12Q12127 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.78□□□□□ -2.69
CCW12Q12127 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.79□□□□□ -2.7
CCW12Q12127 Q0142Q0142 177 nt-1.8□□□□□ -2.7
CCW12Q12127 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.8□□□□□ -2.7
CCW12Q12127 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.82□□□□□ -2.7
CCW12Q12127 YNL337WYNL337W 255 nt-1.83□□□□□ -2.7
CCW12Q12127 YKL225WYKL225W 348 nt-1.84□□□□□ -2.7
CCW12Q12127 snR73snR73 106 nt-1.85□□□□□ -2.71
CCW12Q12127 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.85□□□□□ -2.71
CCW12Q12127 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.9□□□□□ -2.71
CCW12Q12127 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.94□□□□□ -2.72
CCW12Q12127 snR85snR85 171 nt-1.99□□□□□ -2.73
CCW12Q12127 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.01□□□□□ -2.73
CCW12Q12127 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.04□□□□□ -2.74
CCW12Q12127 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.06□□□□□ -2.74
CCW12Q12127 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-2.08□□□□□ -2.74
CCW12Q12127 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-2.1□□□□□ -2.75
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