Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms