Protein–RNA interactions for Protein: Q01589

SED1, Cell wall protein SED1, yeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SED1	Q01589	snR39B	snR39B	96 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	JLP2	YMR132C	627 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	snR49	snR49	165 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	RPL39	YJL189W	156 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	YPR012W	YPR012W	255 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	YER181C	YER181C	324 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	RDS3	YPR094W	324 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SED1	Q01589	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
SED1	Q01589	snR55	snR55	98 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SED1	Q01589	YOR302W	YOR302W	78 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SED1	Q01589	GIM4	YEL003W	336 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SED1	Q01589	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
SED1	Q01589	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SED1	Q01589	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SED1	Q01589	YBR178W	YBR178W	375 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SED1	Q01589	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	snR161	snR161	161 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	snR67	snR67	82 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	snR65	snR65	100 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	snR48	snR48	113 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
SED1	Q01589	YNL205C	YNL205C	423 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
SED1	Q01589	snR52	snR52	92 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
SED1	Q01589	snR80	snR80	171 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
SED1	Q01589	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SED1	Q01589	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SED1	Q01589	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
SED1	Q01589	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
SED1	Q01589	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
SED1	Q01589	snR77	snR77	88 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	YOR102W	YOR102W	351 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	snR56	snR56	88 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	YBL053W	YBL053W	375 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SED1	Q01589	YNL198C	YNL198C	303 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
SED1	Q01589	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
SED1	Q01589	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
SED1	Q01589	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
SED1	Q01589	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
SED1	Q01589	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
SED1	Q01589	YJL150W	YJL150W	303 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
SED1	Q01589	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
SED1	Q01589	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SED1	Q01589	snR81	snR81	201 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
SED1	Q01589	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SED1	Q01589	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
SED1	Q01589	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
SED1	Q01589	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
SED1	Q01589	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
SED1	Q01589	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SED1	Q01589	YOR309C	YOR309C	381 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SED1	Q01589	snR38	snR38	95 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SED1	Q01589	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SED1	Q01589	RPL41A	YDL184C	78 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
SED1	Q01589	YGR151C	YGR151C	336 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
SED1	Q01589	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
SED1	Q01589	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
SED1	Q01589	SPG3	YDR504C	384 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
SED1	Q01589	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
SED1	Q01589	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
SED1	Q01589	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
SED1	Q01589	snR47	snR47	99 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
SED1	Q01589	snR6	snR6	112 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
SED1	Q01589	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
SED1	Q01589	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
SED1	Q01589	Q0142	Q0142	177 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
SED1	Q01589	YNL338W	YNL338W	159 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
SED1	Q01589	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
SED1	Q01589	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
SED1	Q01589	snR73	snR73	106 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
SED1	Q01589	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
SED1	Q01589	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
SED1	Q01589	YKL225W	YKL225W	348 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
SED1	Q01589	YNL337W	YNL337W	255 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
SED1	Q01589	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
SED1	Q01589	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
SED1	Q01589	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
SED1	Q01589	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
SED1	Q01589	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
SED1	Q01589	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
SED1	Q01589	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
SED1	Q01589	snR85	snR85	171 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
SED1	Q01589	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
SED1	Q01589	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-1.44	□□□□□ -2.64

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