Protein–RNA interactions for Protein: Q01589

SED1, Cell wall protein SED1, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1Q01589 snR39BsnR39B 96 nt-0.49□□□□□ -2.49
SED1Q01589 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
SED1Q01589 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
SED1Q01589 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
SED1Q01589 JLP2YMR132C 627 nt-0.5□□□□□ -2.49
SED1Q01589 snR49snR49 165 nt-0.5□□□□□ -2.49
SED1Q01589 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.51□□□□□ -2.49
SED1Q01589 RPL39YJL189W 156 nt-0.51□□□□□ -2.49
SED1Q01589 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.51□□□□□ -2.49
SED1Q01589 YPR012WYPR012W 255 nt-0.51□□□□□ -2.49
SED1Q01589 YER181CYER181C 324 nt-0.52□□□□□ -2.49
SED1Q01589 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.52□□□□□ -2.49
SED1Q01589 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.52□□□□□ -2.49
SED1Q01589 RDS3YPR094W 324 nt-0.52□□□□□ -2.49
SED1Q01589 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.54□□□□□ -2.5
SED1Q01589 snR55snR55 98 nt-0.55□□□□□ -2.5
SED1Q01589 YOR302WYOR302W 78 nt-0.55□□□□□ -2.5
SED1Q01589 GIM4YEL003W 336 nt-0.56□□□□□ -2.5
SED1Q01589 SKI7YOR076C 2244 nt-0.57□□□□□ -2.5
SED1Q01589 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.59□□□□□ -2.5
SED1Q01589 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.59□□□□□ -2.5
SED1Q01589 YBR178WYBR178W 375 nt-0.59□□□□□ -2.5
SED1Q01589 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.6□□□□□ -2.51
SED1Q01589 snR161snR161 161 nt-0.6□□□□□ -2.51
SED1Q01589 snR67snR67 82 nt-0.61□□□□□ -2.51
SED1Q01589 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.61□□□□□ -2.51
SED1Q01589 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.61□□□□□ -2.51
SED1Q01589 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.62□□□□□ -2.51
SED1Q01589 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.63□□□□□ -2.51
SED1Q01589 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.64□□□□□ -2.51
SED1Q01589 snR65snR65 100 nt-0.65□□□□□ -2.51
SED1Q01589 snR48snR48 113 nt-0.65□□□□□ -2.51
SED1Q01589 YNL205CYNL205C 423 nt-0.66□□□□□ -2.52
SED1Q01589 snR52snR52 92 nt-0.66□□□□□ -2.52
SED1Q01589 snR80snR80 171 nt-0.68□□□□□ -2.52
SED1Q01589 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.69□□□□□ -2.52
SED1Q01589 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-0.69□□□□□ -2.52
SED1Q01589 YNR077CYNR077C 255 nt-0.7□□□□□ -2.52
SED1Q01589 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.71□□□□□ -2.52
SED1Q01589 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.71□□□□□ -2.52
SED1Q01589 snR77snR77 88 nt-0.73□□□□□ -2.53
SED1Q01589 YOR102WYOR102W 351 nt-0.73□□□□□ -2.53
SED1Q01589 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.74□□□□□ -2.53
SED1Q01589 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.74□□□□□ -2.53
SED1Q01589 snR56snR56 88 nt-0.75□□□□□ -2.53
SED1Q01589 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.75□□□□□ -2.53
SED1Q01589 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.76□□□□□ -2.53
SED1Q01589 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.77□□□□□ -2.53
SED1Q01589 YBL053WYBL053W 375 nt-0.78□□□□□ -2.53
SED1Q01589 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.78□□□□□ -2.53
SED1Q01589 YNL198CYNL198C 303 nt-0.79□□□□□ -2.54
SED1Q01589 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.79□□□□□ -2.54
SED1Q01589 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.8□□□□□ -2.54
SED1Q01589 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.83□□□□□ -2.54
SED1Q01589 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.84□□□□□ -2.54
SED1Q01589 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.86□□□□□ -2.55
SED1Q01589 YJL150WYJL150W 303 nt-0.86□□□□□ -2.55
SED1Q01589 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.86□□□□□ -2.55
SED1Q01589 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.87□□□□□ -2.55
SED1Q01589 snR81snR81 201 nt-0.88□□□□□ -2.55
SED1Q01589 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.89□□□□□ -2.55
SED1Q01589 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.9□□□□□ -2.55
SED1Q01589 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.95□□□□□ -2.56
SED1Q01589 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.95□□□□□ -2.56
SED1Q01589 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.96□□□□□ -2.56
SED1Q01589 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.99□□□□□ -2.57
SED1Q01589 YOR309CYOR309C 381 nt-0.99□□□□□ -2.57
SED1Q01589 snR38snR38 95 nt-0.99□□□□□ -2.57
SED1Q01589 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.01□□□□□ -2.57
SED1Q01589 RPL41AYDL184C 78 nt-1.02□□□□□ -2.57
SED1Q01589 YGR151CYGR151C 336 nt-1.02□□□□□ -2.57
SED1Q01589 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.02□□□□□ -2.57
SED1Q01589 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.03□□□□□ -2.57
SED1Q01589 SPG3YDR504C 384 nt-1.06□□□□□ -2.58
SED1Q01589 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.07□□□□□ -2.58
SED1Q01589 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.09□□□□□ -2.58
SED1Q01589 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.1□□□□□ -2.59
SED1Q01589 snR47snR47 99 nt-1.11□□□□□ -2.59
SED1Q01589 snR6snR6 112 nt-1.12□□□□□ -2.59
SED1Q01589 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.15□□□□□ -2.59
SED1Q01589 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.17□□□□□ -2.6
SED1Q01589 Q0142Q0142 177 nt-1.19□□□□□ -2.6
SED1Q01589 YNL338WYNL338W 159 nt-1.19□□□□□ -2.6
SED1Q01589 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.19□□□□□ -2.6
SED1Q01589 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.2□□□□□ -2.6
SED1Q01589 snR73snR73 106 nt-1.22□□□□□ -2.6
SED1Q01589 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.24□□□□□ -2.61
SED1Q01589 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.25□□□□□ -2.61
SED1Q01589 YKL225WYKL225W 348 nt-1.25□□□□□ -2.61
SED1Q01589 YNL337WYNL337W 255 nt-1.25□□□□□ -2.61
SED1Q01589 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.25□□□□□ -2.61
SED1Q01589 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.27□□□□□ -2.61
SED1Q01589 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.31□□□□□ -2.62
SED1Q01589 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.32□□□□□ -2.62
SED1Q01589 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.37□□□□□ -2.63
SED1Q01589 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.37□□□□□ -2.63
SED1Q01589 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.38□□□□□ -2.63
SED1Q01589 snR85snR85 171 nt-1.39□□□□□ -2.63
SED1Q01589 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.39□□□□□ -2.63
SED1Q01589 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.44□□□□□ -2.64
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