Protein–RNA interactions for Protein: P23248

RPS1B, 40S ribosomal protein S1-B, yeast

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	P23248	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
RPS1B	P23248	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
RPS1B	P23248	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
RPS1B	P23248	YJR157W	YJR157W	363 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
RPS1B	P23248	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
RPS1B	P23248	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
RPS1B	P23248	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-1.85	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	YBR178W	YBR178W	375 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	YNL205C	YNL205C	423 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	YPR197C	YPR197C	564 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
RPS1B	P23248	YER181C	YER181C	324 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
RPS1B	P23248	snR77	snR77	88 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
RPS1B	P23248	RPL39	YJL189W	156 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
RPS1B	P23248	YDR413C	YDR413C	576 nt		-2	□□□□□ -2.73
RPS1B	P23248	snR81	snR81	201 nt		-2.02	□□□□□ -2.73
RPS1B	P23248	YDR157W	YDR157W	402 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
RPS1B	P23248	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
RPS1B	P23248	snR55	snR55	98 nt		-2.07	□□□□□ -2.74
RPS1B	P23248	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
RPS1B	P23248	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-2.09	□□□□□ -2.74
RPS1B	P23248	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-2.1	□□□□□ -2.75
RPS1B	P23248	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-2.1	□□□□□ -2.75
RPS1B	P23248	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-2.11	□□□□□ -2.75
RPS1B	P23248	YOR102W	YOR102W	351 nt		-2.12	□□□□□ -2.75
RPS1B	P23248	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-2.13	□□□□□ -2.75
RPS1B	P23248	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
RPS1B	P23248	snR48	snR48	113 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
RPS1B	P23248	YKL118W	YKL118W	312 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
RPS1B	P23248	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-2.17	□□□□□ -2.76
RPS1B	P23248	Q0017	Q0017	162 nt		-2.18	□□□□□ -2.76
RPS1B	P23248	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-2.2	□□□□□ -2.76
RPS1B	P23248	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-2.23	□□□□□ -2.77
RPS1B	P23248	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-2.27	□□□□□ -2.77
RPS1B	P23248	GIM4	YEL003W	336 nt		-2.28	□□□□□ -2.77
RPS1B	P23248	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		-2.3	□□□□□ -2.78
RPS1B	P23248	YOR302W	YOR302W	78 nt		-2.32	□□□□□ -2.78
RPS1B	P23248	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-2.34	□□□□□ -2.78
RPS1B	P23248	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-2.36	□□□□□ -2.79
RPS1B	P23248	snR52	snR52	92 nt		-2.36	□□□□□ -2.79
RPS1B	P23248	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-2.38	□□□□□ -2.79
RPS1B	P23248	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-2.39	□□□□□ -2.79
RPS1B	P23248	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.4	□□□□□ -2.79
RPS1B	P23248	YPR012W	YPR012W	255 nt		-2.45	□□□□□ -2.8
RPS1B	P23248	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-2.46	□□□□□ -2.8
RPS1B	P23248	VAR1	Q0140	1197 nt		-2.47	□□□□□ -2.8
RPS1B	P23248	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-2.48	□□□□□ -2.81
RPS1B	P23248	YJL150W	YJL150W	303 nt		-2.52	□□□□□ -2.81
RPS1B	P23248	snR65	snR65	100 nt		-2.55	□□□□□ -2.82
RPS1B	P23248	YNL198C	YNL198C	303 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
RPS1B	P23248	snR56	snR56	88 nt		-2.66	□□□□□ -2.84
RPS1B	P23248	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.66	□□□□□ -2.84
RPS1B	P23248	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-2.67	□□□□□ -2.84
RPS1B	P23248	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-2.69	□□□□□ -2.84
RPS1B	P23248	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-2.71	□□□□□ -2.84
RPS1B	P23248	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-2.73	□□□□□ -2.85
RPS1B	P23248	RPL41A	YDL184C	78 nt		-2.74	□□□□□ -2.85
RPS1B	P23248	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
RPS1B	P23248	snR80	snR80	171 nt		-2.8	□□□□□ -2.86
RPS1B	P23248	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-2.82	□□□□□ -2.86
RPS1B	P23248	snR6	snR6	112 nt		-2.88	□□□□□ -2.87
RPS1B	P23248	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-2.88	□□□□□ -2.87
RPS1B	P23248	snR38	snR38	95 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
RPS1B	P23248	YBL053W	YBL053W	375 nt		-2.91	□□□□□ -2.88
RPS1B	P23248	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-2.95	□□□□□ -2.88
RPS1B	P23248	YGR151C	YGR151C	336 nt		-3.01	□□□□□ -2.89
RPS1B	P23248	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-3.02	□□□□□ -2.89
RPS1B	P23248	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-3.02	□□□□□ -2.89
RPS1B	P23248	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-3.03	□□□□□ -2.89
RPS1B	P23248	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-3.04	□□□□□ -2.9
RPS1B	P23248	snR73	snR73	106 nt		-3.06	□□□□□ -2.9
RPS1B	P23248	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-3.06	□□□□□ -2.9
RPS1B	P23248	Q0142	Q0142	177 nt		-3.12	□□□□□ -2.91
RPS1B	P23248	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-3.13	□□□□□ -2.91
RPS1B	P23248	snR47	snR47	99 nt		-3.14	□□□□□ -2.91
RPS1B	P23248	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-3.17	□□□□□ -2.92
RPS1B	P23248	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-3.22	□□□□□ -2.92
RPS1B	P23248	Q0144	Q0144	330 nt		-3.23	□□□□□ -2.93
RPS1B	P23248	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-3.23	□□□□□ -2.93
RPS1B	P23248	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-3.34	□□□□□ -2.94
RPS1B	P23248	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-3.37	□□□□□ -2.95
RPS1B	P23248	snR85	snR85	171 nt		-3.38	□□□□□ -2.95
RPS1B	P23248	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-3.39	□□□□□ -2.95
RPS1B	P23248	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-3.39	□□□□□ -2.95
RPS1B	P23248	YKL225W	YKL225W	348 nt		-3.41	□□□□□ -2.96
RPS1B	P23248	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-3.42	□□□□□ -2.96
RPS1B	P23248	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-3.49	□□□□□ -2.97
RPS1B	P23248	SPG3	YDR504C	384 nt		-3.52	□□□□□ -2.97
RPS1B	P23248	YNL337W	YNL337W	255 nt		-3.64	□□□□□ -2.99
RPS1B	P23248	YJR162C	YJR162C	351 nt		-3.66	□□□□□ -3
RPS1B	P23248	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-3.77	□□□□□ -3.01
RPS1B	P23248	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-3.81	□□□□□ -3.02
RPS1B	P23248	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-3.82	□□□□□ -3.02
RPS1B	P23248	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-3.85	□□□□□ -3.03

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