Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc5Q9R1X5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc5Q9R1X5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc5Q9R1X5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc5Q9R1X5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc5Q9R1X5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc5Q9R1X5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc5Q9R1X5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc5Q9R1X5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc5Q9R1X5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc5Q9R1X5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc5Q9R1X5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc5Q9R1X5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc5Q9R1X5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abcc5Q9R1X5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Abcc5Q9R1X5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Abcc5Q9R1X5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Abcc5Q9R1X5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abcc5Q9R1X5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Abcc5Q9R1X5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Abcc5Q9R1X5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc5Q9R1X5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc5Q9R1X5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc5Q9R1X5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc5Q9R1X5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc5Q9R1X5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc5Q9R1X5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Abcc5Q9R1X5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abcc5Q9R1X5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc5Q9R1X5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc5Q9R1X5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc5Q9R1X5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms