Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRACLQ9P1F3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABRACLQ9P1F3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRACLQ9P1F3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRACLQ9P1F3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms