Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herpud2Q9JJC9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herpud2Q9JJC9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herpud2Q9JJC9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herpud2Q9JJC9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herpud2Q9JJC9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herpud2Q9JJC9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herpud2Q9JJC9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herpud2Q9JJC9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Herpud2Q9JJC9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Herpud2Q9JJC9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herpud2Q9JJC9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herpud2Q9JJC9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Herpud2Q9JJC9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herpud2Q9JJC9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herpud2Q9JJC9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herpud2Q9JJC9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herpud2Q9JJC9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herpud2Q9JJC9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herpud2Q9JJC9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Herpud2Q9JJC9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herpud2Q9JJC9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herpud2Q9JJC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herpud2Q9JJC9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms