Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrpl49Q9CQ40 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl49Q9CQ40 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mrpl49Q9CQ40 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl49Q9CQ40 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms