Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NifkQ91VE6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NifkQ91VE6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NifkQ91VE6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NifkQ91VE6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NifkQ91VE6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms