Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pja2Q80U04 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pja2Q80U04 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pja2Q80U04 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pja2Q80U04 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pja2Q80U04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms