Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pja2Q80U04 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Pja2Q80U04 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pja2Q80U04 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pja2Q80U04 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Pja2Q80U04 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pja2Q80U04 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pja2Q80U04 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pja2Q80U04 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pja2Q80U04 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pja2Q80U04 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pja2Q80U04 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pja2Q80U04 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Pja2Q80U04 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pja2Q80U04 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pja2Q80U04 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pja2Q80U04 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Pja2Q80U04 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Pja2Q80U04 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pja2Q80U04 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pja2Q80U04 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pja2Q80U04 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Pja2Q80U04 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pja2Q80U04 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Pja2Q80U04 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Pja2Q80U04 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pja2Q80U04 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Pja2Q80U04 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pja2Q80U04 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pja2Q80U04 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pja2Q80U04 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pja2Q80U04 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Pja2Q80U04 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Pja2Q80U04 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Pja2Q80U04 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pja2Q80U04 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pja2Q80U04 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Pja2Q80U04 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pja2Q80U04 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Pja2Q80U04 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pja2Q80U04 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pja2Q80U04 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pja2Q80U04 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pja2Q80U04 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pja2Q80U04 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pja2Q80U04 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pja2Q80U04 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Pja2Q80U04 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pja2Q80U04 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pja2Q80U04 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pja2Q80U04 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Pja2Q80U04 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pja2Q80U04 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pja2Q80U04 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pja2Q80U04 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pja2Q80U04 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pja2Q80U04 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pja2Q80U04 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pja2Q80U04 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pja2Q80U04 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pja2Q80U04 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pja2Q80U04 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Pja2Q80U04 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Pja2Q80U04 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pja2Q80U04 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pja2Q80U04 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pja2Q80U04 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pja2Q80U04 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pja2Q80U04 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pja2Q80U04 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pja2Q80U04 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pja2Q80U04 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pja2Q80U04 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pja2Q80U04 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pja2Q80U04 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pja2Q80U04 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pja2Q80U04 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pja2Q80U04 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pja2Q80U04 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pja2Q80U04 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pja2Q80U04 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pja2Q80U04 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pja2Q80U04 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pja2Q80U04 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pja2Q80U04 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pja2Q80U04 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pja2Q80U04 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pja2Q80U04 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pja2Q80U04 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pja2Q80U04 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pja2Q80U04 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pja2Q80U04 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pja2Q80U04 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pja2Q80U04 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pja2Q80U04 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pja2Q80U04 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pja2Q80U04 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pja2Q80U04 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pja2Q80U04 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pja2Q80U04 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms