Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sbno1Q689Z5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sbno1Q689Z5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sbno1Q689Z5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sbno1Q689Z5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Sbno1Q689Z5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sbno1Q689Z5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sbno1Q689Z5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sbno1Q689Z5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sbno1Q689Z5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sbno1Q689Z5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sbno1Q689Z5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sbno1Q689Z5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sbno1Q689Z5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sbno1Q689Z5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Sbno1Q689Z5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sbno1Q689Z5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sbno1Q689Z5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sbno1Q689Z5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sbno1Q689Z5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sbno1Q689Z5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sbno1Q689Z5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sbno1Q689Z5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sbno1Q689Z5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sbno1Q689Z5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Sbno1Q689Z5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sbno1Q689Z5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sbno1Q689Z5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sbno1Q689Z5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sbno1Q689Z5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Sbno1Q689Z5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sbno1Q689Z5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sbno1Q689Z5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms