Protein–RNA interactions for Protein: Q12159

YRA1, RNA annealing protein YRA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRA1Q12159 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.59□□□□□ -1.19
YRA1Q12159 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.59□□□□□ -1.19
YRA1Q12159 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.59□□□□□ -1.19
YRA1Q12159 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.59□□□□□ -1.19
YRA1Q12159 RPL12BYDR418W 498 nt7.59□□□□□ -1.19
YRA1Q12159 YKL053WYKL053W 375 nt7.59□□□□□ -1.19
YRA1Q12159 FSH2YMR222C 672 nt7.59□□□□□ -1.19
YRA1Q12159 snR31snR31 225 nt7.59□□□□□ -1.19
YRA1Q12159 SAM50YNL026W 1455 nt7.59□□□□□ -1.19
YRA1Q12159 RPN14YGL004C 1254 nt7.58□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 PHB2YGR231C 933 nt7.58□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 ADH3YMR083W 1128 nt7.58□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 ODC1YPL134C 933 nt7.58□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 CWP2YKL096W-A 279 nt7.57□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 IPL1YPL209C 1104 nt7.57□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 YLR173WYLR173W 1827 nt7.56□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 MFG1YDL233W 1377 nt7.56□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 YKR012CYKR012C 378 nt7.55□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 YOR268CYOR268C 399 nt7.55□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 RIM2YBR192W 1134 nt7.55□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 FLX1YIL134W 936 nt7.54□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 YOR343CYOR343C 327 nt7.54□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 RPC31YNL151C 756 nt7.53□□□□□ -1.2
YRA1Q12159 KGD2YDR148C 1392 nt7.52□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 YMR209CYMR209C 1374 nt7.52□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 MOB1YIL106W 945 nt7.52□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 REX2YLR059C 810 nt7.52□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 SAN1YDR143C 1833 nt7.52□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 SRP54YPR088C 1626 nt7.52□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 YCR025CYCR025C 411 nt7.51□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 SWM1YDR260C 513 nt7.51□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 DPL1YDR294C 1770 nt7.51□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 TOM71YHR117W 1920 nt7.5□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 SDS24YBR214W 1584 nt7.5□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 KRR1YCL059C 951 nt7.5□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 VBA3YCL069W 1377 nt7.48□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.48□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 MDM35YKL053C-A 261 nt7.48□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 PUS7YOR243C 2031 nt7.48□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 ACO2YJL200C 2370 nt7.47□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 TPN1YGL186C 1740 nt7.47□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 SNU66YOR308C 1764 nt7.46□□□□□ -1.21
YRA1Q12159 PAU21YOR394W 495 nt7.46□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 PAU22YPL282C 495 nt7.46□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 DMA2YNL116W 1569 nt7.46□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 CYC3YAL039C 810 nt7.45□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 RTG2YGL252C 1767 nt7.45□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 ENO1YGR254W 1314 nt7.45□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 ADE2YOR128C 1716 nt7.44□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 LYS20YDL182W 1287 nt7.44□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 HOG1YLR113W 1308 nt7.44□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 SBP1YHL034C 885 nt7.43□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 SER2YGR208W 930 nt7.42□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 YPT11YNL304W 1254 nt7.42□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 GAS1YMR307W 1680 nt7.41□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 LEU4YNL104C 1860 nt7.41□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 PTC6YCR079W 1329 nt7.41□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 SRP102YKL154W 735 nt7.4□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 YLR280CYLR280C 351 nt7.4□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 YMR007WYMR007W 381 nt7.4□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 THI6YPL214C 1623 nt7.4□□□□□ -1.22
YRA1Q12159 YFR020WYFR020W 699 nt7.39□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 THI3YDL080C 1830 nt7.38□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 HXT10YFL011W 1641 nt7.38□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 HRA1HRA1 564 nt7.38□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 ERO1YML130C 1692 nt7.38□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 HTS1YPR033C 1641 nt7.38□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 YDR467CYDR467C 327 nt7.37□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 GPM1YKL152C 744 nt7.37□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.37□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 GGA2YHR108W 1758 nt7.37□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 PSD1YNL169C 1503 nt7.37□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.36□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 YMR206WYMR206W 942 nt7.36□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 RCR1YBR005W 642 nt7.36□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 YHR218WYHR218W 1812 nt7.36□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 EDC2YER035W 438 nt7.35□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 YGR210CYGR210C 1236 nt7.35□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.34□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.34□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 RSM7YJR113C 744 nt7.34□□□□□ -1.23
YRA1Q12159 GCD11YER025W 1584 nt7.33□□□□□ -1.24
YRA1Q12159 AGP3YFL055W 1677 nt7.32□□□□□ -1.24
YRA1Q12159 INH1YDL181W 258 nt7.32□□□□□ -1.24
YRA1Q12159 CYT1YOR065W 930 nt7.32□□□□□ -1.24
YRA1Q12159 FCY1YPR062W 477 nt7.3□□□□□ -1.24
YRA1Q12159 NPP2YEL016C 1482 nt7.3□□□□□ -1.24
YRA1Q12159 YBL095WYBL095W 813 nt7.29□□□□□ -1.24
YRA1Q12159 YPL108WYPL108W 507 nt7.29□□□□□ -1.24
YRA1Q12159 MAM3YOL060C 2121 nt7.28□□□□□ -1.24
YRA1Q12159 MTO1YGL236C 2010 nt7.27□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 HXK1YFR053C 1458 nt7.27□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 GRH1YDR517W 1119 nt7.26□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 AAC3YBR085W 924 nt7.26□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 YMC2YBR104W 990 nt7.26□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 YEL023CYEL023C 2049 nt7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.7 ms