Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 RIB1YBL033C 1038 nt8.2□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 RIM8YGL045W 1629 nt8.2□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 SER2YGR208W 930 nt8.19□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 SRP102YKL154W 735 nt8.18□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 RCR1YBR005W 642 nt8.18□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 YGL114WYGL114W 2178 nt8.18□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 HTS1YPR033C 1641 nt8.18□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 VBA3YCL069W 1377 nt8.16□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 LYS20YDL182W 1287 nt8.16□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 SOD2YHR008C 702 nt8.16□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 RSM7YJR113C 744 nt8.16□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 YLR280CYLR280C 351 nt8.16□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 YMR007WYMR007W 381 nt8.16□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 RPC31YNL151C 756 nt8.16□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 SBP1YHL034C 885 nt8.15□□□□□ -1.1
CCE1Q03702 KGD2YDR148C 1392 nt8.14□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 ZAP1YJL056C 2643 nt8.14□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 SAN1YDR143C 1833 nt8.13□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 ILV2YMR108W 2064 nt8.13□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 ERO1YML130C 1692 nt8.12□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 GAS1YMR307W 1680 nt8.12□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 ODC1YPL134C 933 nt8.12□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 RIM2YBR192W 1134 nt8.12□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 SSL2YIL143C 2532 nt8.11□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 PTC6YCR079W 1329 nt8.1□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 YGR210CYGR210C 1236 nt8.1□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 DTR1YBR180W 1719 nt8.09□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 SWM1YDR260C 513 nt8.09□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 MDM35YKL053C-A 261 nt8.09□□□□□ -1.11
CCE1Q03702 YFR020WYFR020W 699 nt8.08□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 YLR460CYLR460C 1131 nt8.08□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 FCY1YPR062W 477 nt8.08□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.07□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.07□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.07□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.07□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.07□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 GTB1YDR221W 2109 nt8.07□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 ERG6YML008C 1152 nt8.07□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 GGA2YHR108W 1758 nt8.05□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 INH1YDL181W 258 nt8.05□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 URA8YJR103W 1737 nt8.04□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 YDR467CYDR467C 327 nt8.04□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 DMA2YNL116W 1569 nt8.03□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 CYT1YOR065W 930 nt8.03□□□□□ -1.12
CCE1Q03702 YMR209CYMR209C 1374 nt8.02□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 GPM1YKL152C 744 nt8.02□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 CHS7YHR142W 951 nt8.01□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 YPL108WYPL108W 507 nt8.01□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 YRF1-3YGR296W 5580 nt8□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 YRF1-6YNL339C 5580 nt8□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 YRF1-7YPL283C 5580 nt8□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 DPL1YDR294C 1770 nt8□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 OLA1YBR025C 1185 nt8□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 YIL177CYIL177C 5277 nt7.98□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 YMR166CYMR166C 1107 nt7.98□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 YMC2YBR104W 990 nt7.98□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 YIR035CYIR035C 765 nt7.97□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 LSP1YPL004C 1026 nt7.97□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 POP2YNR052C 1302 nt7.97□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 LEU4YNL104C 1860 nt7.96□□□□□ -1.13
CCE1Q03702 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.96□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 YBL095WYBL095W 813 nt7.96□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 RRT14YIL127C 621 nt7.94□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 TOK1YJL093C 2076 nt7.94□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 THI3YDL080C 1830 nt7.94□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 MRS4YKR052C 915 nt7.93□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 PSD1YNL169C 1503 nt7.93□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.91□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 YJL009WYJL009W 327 nt7.91□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 HEM14YER014W 1620 nt7.9□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 TMS1YDR105C 1422 nt7.9□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 OCH1YGL038C 1443 nt7.9□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.9□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.9□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 CAK1YFL029C 1107 nt7.9□□□□□ -1.14
CCE1Q03702 HXT10YFL011W 1641 nt7.89□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 YPR084WYPR084W 1371 nt7.89□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 YPT31YER031C 672 nt7.89□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 YJL160CYJL160C 864 nt7.89□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 YJR149WYJR149W 1215 nt7.89□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 MET22YOL064C 1074 nt7.89□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 EMC3YKL207W 762 nt7.88□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 MFT1YML062C 1179 nt7.88□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 BUB2YMR055C 921 nt7.88□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 AAC3YBR085W 924 nt7.88□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 YMR210WYMR210W 1350 nt7.87□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 YMR206WYMR206W 942 nt7.86□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 GRH1YDR517W 1119 nt7.85□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 BUD20YLR074C 501 nt7.85□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 AGP3YFL055W 1677 nt7.85□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 TPN1YGL186C 1740 nt7.84□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 HRA1HRA1 564 nt7.84□□□□□ -1.15
CCE1Q03702 PDC6YGR087C 1692 nt7.83□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 YHR218WYHR218W 1812 nt7.82□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 NPP2YEL016C 1482 nt7.82□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 GAL2YLR081W 1725 nt7.82□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 AAT1YKL106W 1356 nt7.82□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 YHL008CYHL008C 1884 nt7.81□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 MRP1YDR347W 966 nt7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms