Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col6a2Q02788 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col6a2Q02788 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Col6a2Q02788 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col6a2Q02788 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col6a2Q02788 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col6a2Q02788 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Col6a2Q02788 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Col6a2Q02788 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col6a2Q02788 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col6a2Q02788 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col6a2Q02788 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col6a2Q02788 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col6a2Q02788 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms