Protein–RNA interactions for Protein: P53900

GIM3, Prefoldin subunit 4, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM3P53900 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 Q0010Q0010 387 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 HEL1YKR017C 1656 nt7.5□□□□□ -1.21
GIM3P53900 DAK2YFL053W 1776 nt7.49□□□□□ -1.21
GIM3P53900 YBL095WYBL095W 813 nt7.49□□□□□ -1.21
GIM3P53900 BAP3YDR046C 1815 nt7.49□□□□□ -1.21
GIM3P53900 HBS1YKR084C 1836 nt7.49□□□□□ -1.21
GIM3P53900 DAL7YIR031C 1665 nt7.48□□□□□ -1.21
GIM3P53900 FIT1YDR534C 1587 nt7.48□□□□□ -1.21
GIM3P53900 NPP2YEL016C 1482 nt7.48□□□□□ -1.21
GIM3P53900 PMA2YPL036W 2844 nt7.47□□□□□ -1.21
GIM3P53900 SUV3YPL029W 2214 nt7.47□□□□□ -1.21
GIM3P53900 ORT1YOR130C 879 nt7.46□□□□□ -1.22
GIM3P53900 TVP23YDR084C 600 nt7.45□□□□□ -1.22
GIM3P53900 GPM1YKL152C 744 nt7.45□□□□□ -1.22
GIM3P53900 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
GIM3P53900 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
GIM3P53900 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
GIM3P53900 CAB5YDR196C 726 nt7.44□□□□□ -1.22
GIM3P53900 BIM1YER016W 1035 nt7.44□□□□□ -1.22
GIM3P53900 YMC2YBR104W 990 nt7.44□□□□□ -1.22
GIM3P53900 CTF3YLR381W 2202 nt7.43□□□□□ -1.22
GIM3P53900 RIB2YOL066C 1776 nt7.43□□□□□ -1.22
GIM3P53900 FET5YFL041W 1869 nt7.43□□□□□ -1.22
GIM3P53900 YHR131CYHR131C 2553 nt7.42□□□□□ -1.22
GIM3P53900 GGC1YDL198C 903 nt7.42□□□□□ -1.22
GIM3P53900 OPI3YJR073C 621 nt7.42□□□□□ -1.22
GIM3P53900 GGA2YHR108W 1758 nt7.41□□□□□ -1.22
GIM3P53900 MGM101YJR144W 810 nt7.41□□□□□ -1.22
GIM3P53900 CRC1YOR100C 984 nt7.41□□□□□ -1.22
GIM3P53900 SWT21YNL187W 1074 nt7.4□□□□□ -1.22
GIM3P53900 IML3YBR107C 738 nt7.4□□□□□ -1.22
GIM3P53900 LAS17YOR181W 1902 nt7.4□□□□□ -1.23
GIM3P53900 SPS100YHR139C 981 nt7.38□□□□□ -1.23
GIM3P53900 EMC3YKL207W 762 nt7.38□□□□□ -1.23
GIM3P53900 YCR061WYCR061W 1896 nt7.38□□□□□ -1.23
GIM3P53900 SBP1YHL034C 885 nt7.37□□□□□ -1.23
GIM3P53900 MRS4YKR052C 915 nt7.37□□□□□ -1.23
GIM3P53900 ADH6YMR318C 1083 nt7.37□□□□□ -1.23
GIM3P53900 HXT11YOL156W 1704 nt7.37□□□□□ -1.23
GIM3P53900 TRP2YER090W 1524 nt7.37□□□□□ -1.23
GIM3P53900 AAT1YKL106W 1356 nt7.36□□□□□ -1.23
GIM3P53900 YPR126CYPR126C 309 nt7.36□□□□□ -1.23
GIM3P53900 AMF1YOR378W 1548 nt7.36□□□□□ -1.23
GIM3P53900 ENO2YHR174W 1314 nt7.35□□□□□ -1.23
GIM3P53900 YMR210WYMR210W 1350 nt7.34□□□□□ -1.23
GIM3P53900 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.34□□□□□ -1.23
GIM3P53900 ABZ2YMR289W 1125 nt7.34□□□□□ -1.23
GIM3P53900 YNR029CYNR029C 1290 nt7.34□□□□□ -1.23
GIM3P53900 KGD2YDR148C 1392 nt7.33□□□□□ -1.24
GIM3P53900 CIR2YOR356W 1896 nt7.33□□□□□ -1.24
GIM3P53900 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.33□□□□□ -1.24
GIM3P53900 ADE16YLR028C 1776 nt7.33□□□□□ -1.24
GIM3P53900 DIA4YHR011W 1341 nt7.31□□□□□ -1.24
GIM3P53900 ASN2YGR124W 1719 nt7.31□□□□□ -1.24
GIM3P53900 DPH5YLR172C 903 nt7.31□□□□□ -1.24
GIM3P53900 THI3YDL080C 1830 nt7.31□□□□□ -1.24
GIM3P53900 CCT5YJR064W 1689 nt7.31□□□□□ -1.24
GIM3P53900 YIL108WYIL108W 2091 nt7.31□□□□□ -1.24
GIM3P53900 MSB3YNL293W 1902 nt7.31□□□□□ -1.24
GIM3P53900 YIP4YGL198W 708 nt7.29□□□□□ -1.24
GIM3P53900 RBG2YGR173W 1107 nt7.29□□□□□ -1.24
GIM3P53900 snR4snR4 186 nt7.29□□□□□ -1.24
GIM3P53900 LEU2YCL018W 1095 nt7.29□□□□□ -1.24
GIM3P53900 YOS9YDR057W 1629 nt7.29□□□□□ -1.24
GIM3P53900 YEN1YER041W 2280 nt7.27□□□□□ -1.24
GIM3P53900 CBK1YNL161W 2271 nt7.27□□□□□ -1.24
GIM3P53900 CTI6YPL181W 1521 nt7.27□□□□□ -1.25
GIM3P53900 UBP13YBL067C 2244 nt7.27□□□□□ -1.25
GIM3P53900 AFG2YLR397C 2343 nt7.27□□□□□ -1.25
GIM3P53900 ADH1YOL086C 1047 nt7.27□□□□□ -1.25
GIM3P53900 MHF1YOL086W-A 273 nt7.27□□□□□ -1.25
GIM3P53900 HXT13YEL069C 1695 nt7.27□□□□□ -1.25
GIM3P53900 SAN1YDR143C 1833 nt7.27□□□□□ -1.25
GIM3P53900 POP2YNR052C 1302 nt7.27□□□□□ -1.25
GIM3P53900 TMS1YDR105C 1422 nt7.26□□□□□ -1.25
GIM3P53900 MLS1YNL117W 1665 nt7.25□□□□□ -1.25
GIM3P53900 PRP2YNR011C 2631 nt7.25□□□□□ -1.25
GIM3P53900 YKL053WYKL053W 375 nt7.25□□□□□ -1.25
GIM3P53900 SNZ1YMR096W 894 nt7.25□□□□□ -1.25
GIM3P53900 TAF13YML098W 504 nt7.24□□□□□ -1.25
GIM3P53900 YPT11YNL304W 1254 nt7.24□□□□□ -1.25
GIM3P53900 LEA1YPL213W 717 nt7.24□□□□□ -1.25
GIM3P53900 SRP54YPR088C 1626 nt7.23□□□□□ -1.25
GIM3P53900 ADE17YMR120C 1779 nt7.23□□□□□ -1.25
GIM3P53900 snR86snR86 1004 nt7.23□□□□□ -1.25
GIM3P53900 SRM1YGL097W 1449 nt7.23□□□□□ -1.25
GIM3P53900 NMD5YJR132W 3147 nt7.23□□□□□ -1.25
GIM3P53900 GAS1YMR307W 1680 nt7.22□□□□□ -1.25
GIM3P53900 YNL040WYNL040W 1371 nt7.22□□□□□ -1.25
GIM3P53900 YLR072WYLR072W 2082 nt7.22□□□□□ -1.25
GIM3P53900 YJL009WYJL009W 327 nt7.21□□□□□ -1.26
GIM3P53900 GPA1YHR005C 1419 nt7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.1 ms