Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt2P50752 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnnt2P50752 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnnt2P50752 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnt2P50752 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt2P50752 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms