Protein–RNA interactions for Protein: P0CX23

RPL20A, 60S ribosomal protein L20-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL20AP0CX23 VBA3YCL069W 1377 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL20AP0CX23 KGD2YDR148C 1392 nt7.65□□□□□ -1.18
RPL20AP0CX23 HEL2YDR266C 1920 nt7.65□□□□□ -1.18
RPL20AP0CX23 SAM50YNL026W 1455 nt7.65□□□□□ -1.18
RPL20AP0CX23 ENO1YGR254W 1314 nt7.64□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 LYS20YDL182W 1287 nt7.64□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 SER2YGR208W 930 nt7.63□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 DTR1YBR180W 1719 nt7.61□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 HEM14YER014W 1620 nt7.61□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 SWM1YDR260C 513 nt7.61□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 SRP102YKL154W 735 nt7.61□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 YPT11YNL304W 1254 nt7.6□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 YHR218WYHR218W 1812 nt7.59□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 SBP1YHL034C 885 nt7.59□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 YLR280CYLR280C 351 nt7.59□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 HTS1YPR033C 1641 nt7.59□□□□□ -1.19
RPL20AP0CX23 PSD1YNL169C 1503 nt7.58□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 GAS1YMR307W 1680 nt7.58□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 HXT10YFL011W 1641 nt7.58□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 ERO1YML130C 1692 nt7.57□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 YFR020WYFR020W 699 nt7.57□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 YIA6YIL006W 1122 nt7.57□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 PTC6YCR079W 1329 nt7.56□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 LEU4YNL104C 1860 nt7.56□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 RIB1YBL033C 1038 nt7.56□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 ILV2YMR108W 2064 nt7.56□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 YGR210CYGR210C 1236 nt7.54□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 CYT1YOR065W 930 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 MAS1YLR163C 1389 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 AGP3YFL055W 1677 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 MCM5YLR274W 2328 nt7.52□□□□□ -1.2
RPL20AP0CX23 YRF1-2YER190W 5046 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 YDR467CYDR467C 327 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 SOD2YHR008C 702 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 RSM7YJR113C 744 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 YMR007WYMR007W 381 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 NPP1YCR026C 2229 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 THI3YDL080C 1830 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 GGA2YHR108W 1758 nt7.51□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 MAE1YKL029C 2010 nt7.51□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 GPM1YKL152C 744 nt7.51□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 MET2YNL277W 1461 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 INH1YDL181W 258 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 ERG6YML008C 1152 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 RCR1YBR005W 642 nt7.48□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 YPL108WYPL108W 507 nt7.48□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 FCY1YPR062W 477 nt7.48□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 RSC4YKR008W 1878 nt7.47□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 NPP2YEL016C 1482 nt7.47□□□□□ -1.21
RPL20AP0CX23 YBL095WYBL095W 813 nt7.45□□□□□ -1.22
RPL20AP0CX23 YLR460CYLR460C 1131 nt7.43□□□□□ -1.22
RPL20AP0CX23 YMR166CYMR166C 1107 nt7.43□□□□□ -1.22
RPL20AP0CX23 SFP1YLR403W 2052 nt7.42□□□□□ -1.22
RPL20AP0CX23 LSP1YPL004C 1026 nt7.42□□□□□ -1.22
RPL20AP0CX23 RFC1YOR217W 2586 nt7.41□□□□□ -1.22
RPL20AP0CX23 YJL160CYJL160C 864 nt7.41□□□□□ -1.22
RPL20AP0CX23 AAC3YBR085W 924 nt7.4□□□□□ -1.22
RPL20AP0CX23 POP2YNR052C 1302 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 CHS7YHR142W 951 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 MET22YOL064C 1074 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 YMC2YBR104W 990 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 TMS1YDR105C 1422 nt7.38□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.38□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 CAK1YFL029C 1107 nt7.38□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 YIR035CYIR035C 765 nt7.38□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 OCH1YGL038C 1443 nt7.37□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 RRT14YIL127C 621 nt7.37□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 EMC3YKL207W 762 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 MRS4YKR052C 915 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 RNA170RNA170 169 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 OLA1YBR025C 1185 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 FET5YFL041W 1869 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 YHL008CYHL008C 1884 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 NBA1YOL070C 1506 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 AAT1YKL106W 1356 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 YMR210WYMR210W 1350 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 PDC6YGR087C 1692 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 PET18YCR020C 648 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 MTO1YGL236C 2010 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 YJR149WYJR149W 1215 nt7.34□□□□□ -1.23
RPL20AP0CX23 BUB2YMR055C 921 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 TPN1YGL186C 1740 nt7.32□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 GAL2YLR081W 1725 nt7.32□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 TPO4YOR273C 1980 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 snR86snR86 1004 nt7.3□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 YER156CYER156C 1017 nt7.3□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 YJL009WYJL009W 327 nt7.3□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 TRP2YER090W 1524 nt7.3□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 YBR056WYBR056W 1506 nt7.3□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 THI6YPL214C 1623 nt7.3□□□□□ -1.24
RPL20AP0CX23 GRH1YDR517W 1119 nt7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms