Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RngttO55236 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RngttO55236 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RngttO55236 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RngttO55236 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RngttO55236 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RngttO55236 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RngttO55236 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RngttO55236 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RngttO55236 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RngttO55236 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RngttO55236 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RngttO55236 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RngttO55236 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RngttO55236 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RngttO55236 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RngttO55236 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RngttO55236 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RngttO55236 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RngttO55236 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RngttO55236 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RngttO55236 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RngttO55236 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RngttO55236 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RngttO55236 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RngttO55236 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RngttO55236 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RngttO55236 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RngttO55236 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RngttO55236 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RngttO55236 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RngttO55236 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RngttO55236 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RngttO55236 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RngttO55236 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RngttO55236 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RngttO55236 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RngttO55236 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RngttO55236 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RngttO55236 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RngttO55236 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RngttO55236 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RngttO55236 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RngttO55236 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RngttO55236 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RngttO55236 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RngttO55236 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RngttO55236 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RngttO55236 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RngttO55236 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RngttO55236 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RngttO55236 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RngttO55236 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RngttO55236 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RngttO55236 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RngttO55236 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RngttO55236 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RngttO55236 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RngttO55236 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RngttO55236 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RngttO55236 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RngttO55236 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RngttO55236 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RngttO55236 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RngttO55236 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RngttO55236 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RngttO55236 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RngttO55236 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RngttO55236 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RngttO55236 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RngttO55236 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RngttO55236 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RngttO55236 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RngttO55236 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RngttO55236 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RngttO55236 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RngttO55236 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RngttO55236 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RngttO55236 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RngttO55236 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RngttO55236 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RngttO55236 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RngttO55236 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RngttO55236 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RngttO55236 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RngttO55236 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RngttO55236 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RngttO55236 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RngttO55236 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RngttO55236 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RngttO55236 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RngttO55236 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RngttO55236 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RngttO55236 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RngttO55236 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RngttO55236 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RngttO55236 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RngttO55236 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RngttO55236 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RngttO55236 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms