Protein–RNA interactions for Protein: D3YU50

Mybpc1, Myosin-binding protein C, slow-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc1D3YU50 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mybpc1D3YU50 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mybpc1D3YU50 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mybpc1D3YU50 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mybpc1D3YU50 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mybpc1D3YU50 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mybpc1D3YU50 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mybpc1D3YU50 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mybpc1D3YU50 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mybpc1D3YU50 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mybpc1D3YU50 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mybpc1D3YU50 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mybpc1D3YU50 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mybpc1D3YU50 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms