Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms