Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3C1V9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3C1V9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3C1V9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3C1V9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3C1V9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3C1V9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3C1V9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3C1V9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3C1V9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3C1V9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3C1V9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3C1V9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms