Protein–RNA interactions for Protein: Q12018

CDC53, Cell division control protein 53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDC53Q12018 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.4□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.4□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.4□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.4□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 PRP5YBR237W 2550 nt1.39□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 RAD9YDR217C 3930 nt1.38□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 UTP8YGR128C 2142 nt1.38□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 PAU12YGR294W 363 nt1.38□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 PAU24YBR301W 363 nt1.38□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.37□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 YSP1YHR155W 3687 nt1.35□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 FYV10YIL097W 1551 nt1.34□□□□□ -2.19
CDC53Q12018 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.33□□□□□ -2.2
CDC53Q12018 YNL338WYNL338W 159 nt1.33□□□□□ -2.2
CDC53Q12018 YDL073WYDL073W 2955 nt1.32□□□□□ -2.2
CDC53Q12018 YPR117WYPR117W 7470 nt1.3□□□□□ -2.2
CDC53Q12018 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.3□□□□□ -2.2
CDC53Q12018 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.3□□□□□ -2.2
CDC53Q12018 SCC2YDR180W 4482 nt1.3□□□□□ -2.2
CDC53Q12018 UBP3YER151C 2739 nt1.3□□□□□ -2.2
CDC53Q12018 YGL182CYGL182C 324 nt1.28□□□□□ -2.2
CDC53Q12018 LTE1YAL024C 4308 nt1.28□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 YOR170WYOR170W 306 nt1.27□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 SIP4YJL089W 2490 nt1.27□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.26□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.26□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 snR48snR48 113 nt1.26□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 TAH1YCR060W 336 nt1.24□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 YLR232WYLR232W 348 nt1.24□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 SPT7YBR081C 3999 nt1.23□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 SNU13YEL026W 381 nt1.23□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 BEM3YPL115C 3387 nt1.22□□□□□ -2.21
CDC53Q12018 UTP20YBL004W 7482 nt1.2□□□□□ -2.22
CDC53Q12018 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.2□□□□□ -2.22
CDC53Q12018 QCR9YGR183C 201 nt1.2□□□□□ -2.22
CDC53Q12018 YOR102WYOR102W 351 nt1.2□□□□□ -2.22
CDC53Q12018 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.19□□□□□ -2.22
CDC53Q12018 OST4YDL232W 111 nt1.18□□□□□ -2.22
CDC53Q12018 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.18□□□□□ -2.22
CDC53Q12018 CHS6YJL099W 2241 nt1.15□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.14□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.14□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.14□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.14□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.14□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.14□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.14□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.14□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 BEM2YER155C 6504 nt1.13□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 ULP2YIL031W 3105 nt1.12□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 VAM6YDL077C 3150 nt1.11□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.11□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.11□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CDC53Q12018 BUD3YCL014W 4911 nt1.09□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 IQG1YPL242C 4488 nt1.08□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.07□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 YJR029WYJR029W 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 DOP1YDR141C 5097 nt1.06□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.05□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 COG6YNL041C 2520 nt1.04□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 YBL053WYBL053W 375 nt1.04□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 RKR1YMR247C 4689 nt1.03□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 GLG1YKR058W 1851 nt1.03□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 YGR164WYGR164W 336 nt1.03□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.03□□□□□ -2.24
CDC53Q12018 SEC1YDR164C 2175 nt1.02□□□□□ -2.25
CDC53Q12018 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.01□□□□□ -2.25
CDC53Q12018 YDR544CYDR544C 429 nt1□□□□□ -2.25
CDC53Q12018 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1□□□□□ -2.25
CDC53Q12018 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1□□□□□ -2.25
CDC53Q12018 NNF2YGR089W 2811 nt0.99□□□□□ -2.25
CDC53Q12018 ATP8Q0080 147 nt0.97□□□□□ -2.25
CDC53Q12018 SDH6YDR379C-A 240 nt0.96□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 MLP1YKR095W 5628 nt0.96□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.95□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 YOL014WYOL014W 375 nt0.95□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 Q0092Q0092 141 nt0.94□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 YMR160WYMR160W 2451 nt0.94□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.94□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 BUL2YML111W 2763 nt0.93□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.93□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.93□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 snR39BsnR39B 96 nt0.93□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 YNL170WYNL170W 396 nt0.92□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 BIR1YJR089W 2865 nt0.92□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 PET111YMR257C 2403 nt0.9□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 NIP1YMR309C 2439 nt0.9□□□□□ -2.26
CDC53Q12018 YDR210WYDR210W 228 nt0.9□□□□□ -2.27
CDC53Q12018 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.85□□□□□ -2.27
CDC53Q12018 RPS26AYGL189C 360 nt0.83□□□□□ -2.28
CDC53Q12018 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.83□□□□□ -2.28
CDC53Q12018 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.81□□□□□ -2.28
CDC53Q12018 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.81□□□□□ -2.28
CDC53Q12018 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.81□□□□□ -2.28
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