Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 RPL26BYGR034W 384 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE5Q08412 PAU12YGR294W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE5Q08412 snR190snR190 190 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE5Q08412 YJL150WYJL150W 303 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 snR46snR46 197 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 PMP1YCR024C-A 123 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 YJL182CYJL182C 318 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 YNL337WYNL337W 255 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 LTE1YAL024C 4308 nt0.81□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 RKR1YMR247C 4689 nt0.81□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 COX5BYIL111W 456 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 YML002WYML002W 2214 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE5Q08412 FYV10YIL097W 1551 nt0.78□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.77□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.77□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 SEC1YDR164C 2175 nt0.76□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 PRP42YDR235W 1635 nt0.76□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 QCR9YGR183C 201 nt0.76□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.76□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 MYO1YHR023W 5787 nt0.76□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 SEC8YPR055W 3198 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 PRP39YML046W 1890 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 UTP20YBL004W 7482 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 YEL073CYEL073C 324 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 YLR041WYLR041W 321 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 YGR151CYGR151C 336 nt0.73□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 PRP5YBR237W 2550 nt0.73□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 UTP8YGR128C 2142 nt0.73□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE5Q08412 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 TRS65YGR166W 1683 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 CHS6YJL099W 2241 nt0.7□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.7□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YOR225WYOR225W 330 nt0.7□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 TAH1YCR060W 336 nt0.69□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YNL338WYNL338W 159 nt0.69□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YMR160WYMR160W 2451 nt0.69□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YGL182CYGL182C 324 nt0.68□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.68□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 Q0032Q0032 291 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 OST4YDL232W 111 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 SNU13YEL026W 381 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YOL014WYOL014W 375 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE5Q08412 YDR544CYDR544C 429 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE5Q08412 YLR232WYLR232W 348 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE5Q08412 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE5Q08412 YBL053WYBL053W 375 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE5Q08412 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE5Q08412 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE5Q08412 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.61□□□□□ -2.31
CUE5Q08412 BEM3YPL115C 3387 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE5Q08412 MLP1YKR095W 5628 nt0.59□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 YSP1YHR155W 3687 nt0.59□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 YLR294CYLR294C 330 nt0.58□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 YOR170WYOR170W 306 nt0.58□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 YOR102WYOR102W 351 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 snR48snR48 113 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 NNF2YGR089W 2811 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 COG6YNL041C 2520 nt0.55□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.55□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.55□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 SDH6YDR379C-A 240 nt0.54□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 PET111YMR257C 2403 nt0.54□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.53□□□□□ -2.32
CUE5Q08412 snR39BsnR39B 96 nt0.52□□□□□ -2.33
CUE5Q08412 IQG1YPL242C 4488 nt0.52□□□□□ -2.33
CUE5Q08412 FMP27YLR454W 7887 nt0.52□□□□□ -2.33
CUE5Q08412 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.5□□□□□ -2.33
CUE5Q08412 YDR210WYDR210W 228 nt0.5□□□□□ -2.33
CUE5Q08412 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.5□□□□□ -2.33
CUE5Q08412 MLP2YIL149C 5040 nt0.5□□□□□ -2.33
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