Protein–RNA interactions for Protein: Q06485

ATG33, Autophagy-related protein 33, yeastyeast

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG33Q06485 YLR232WYLR232W 348 nt1.24□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.24□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.24□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 YNL170WYNL170W 396 nt1.23□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 REV3YPL167C 4515 nt1.23□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 CHS6YJL099W 2241 nt1.23□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 CCH1YGR217W 6120 nt1.23□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.22□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 CDC31YOR257W 486 nt1.22□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 LAA1YJL207C 6045 nt1.21□□□□□ -2.21
ATG33Q06485 CAT8YMR280C 4302 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 SDH6YDR379C-A 240 nt1.2□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.19□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 SPT7YBR081C 3999 nt1.19□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 MSH3YCR092C 3057 nt1.17□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 BEM3YPL115C 3387 nt1.17□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 NUP192YJL039C 5052 nt1.17□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.17□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 UBP3YER151C 2739 nt1.16□□□□□ -2.22
ATG33Q06485 YSP1YHR155W 3687 nt1.15□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.15□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 RPM2YML091C 3609 nt1.14□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.13□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 YGR130CYGR130C 2451 nt1.12□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 NST1YNL091W 3723 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 SCC2YDR180W 4482 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 YDR544CYDR544C 429 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 YDL073WYDL073W 2955 nt1.1□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 QCR9YGR183C 201 nt1.09□□□□□ -2.23
ATG33Q06485 OST4YDL232W 111 nt1.08□□□□□ -2.24
ATG33Q06485 COG6YNL041C 2520 nt1.06□□□□□ -2.24
ATG33Q06485 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.06□□□□□ -2.24
ATG33Q06485 YPR117WYPR117W 7470 nt1.03□□□□□ -2.24
ATG33Q06485 snR39BsnR39B 96 nt1.03□□□□□ -2.24
ATG33Q06485 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.01□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 ULP2YIL031W 3105 nt1□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 RKR1YMR247C 4689 nt1□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 GLG1YKR058W 1851 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 YDR210WYDR210W 228 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 LTE1YAL024C 4308 nt0.98□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.97□□□□□ -2.25
ATG33Q06485 SOM1YEL059C-A 225 nt0.96□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 VAM6YDL077C 3150 nt0.96□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 SEC1YDR164C 2175 nt0.95□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 NNF2YGR089W 2811 nt0.94□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.94□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.94□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 IML1YJR138W 4755 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 DOP1YDR141C 5097 nt0.93□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 YJR029WYJR029W 5268 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG33Q06485 BEM2YER155C 6504 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG33Q06485 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG33Q06485 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG33Q06485 YBR099CYBR099C 384 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG33Q06485 YNL205CYNL205C 423 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG33Q06485 PET111YMR257C 2403 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG33Q06485 SIP4YJL089W 2490 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG33Q06485 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG33Q06485 CSE1YGL238W 2883 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG33Q06485 NIP1YMR309C 2439 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG33Q06485 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG33Q06485 STF2YGR008C 255 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG33Q06485 HUG1YML058W-A 207 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG33Q06485 MLP1YKR095W 5628 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG33Q06485 BUL2YML111W 2763 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG33Q06485 BIR1YJR089W 2865 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG33Q06485 BUD3YCL014W 4911 nt0.78□□□□□ -2.29
ATG33Q06485 RPS26AYGL189C 360 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG33Q06485 Q0143Q0143 153 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG33Q06485 ANS1YHR126C 480 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG33Q06485 PAU12YGR294W 363 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG33Q06485 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG33Q06485 PAU24YBR301W 363 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG33Q06485 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG33Q06485 YNL266WYNL266W 420 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG33Q06485 PMP2YEL017C-A 132 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG33Q06485 RCO1YMR075W 2055 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG33Q06485 snR85snR85 171 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG33Q06485 SBH1YER087C-B 249 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG33Q06485 SEC10YLR166C 2616 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG33Q06485 ORC3YLL004W 1851 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG33Q06485 IQG1YPL242C 4488 nt0.65□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78.1 ms