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Protein–RNA interactions for Protein: Q04049
RAD30, DNA polymerase eta, yeast
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632 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RAD30
Q04049
UBP3
YER151C
2739 nt
0.81
□□□□□ -2.28
RAD30
Q04049
BEM3
YPL115C
3387 nt
0.81
□□□□□ -2.28
RAD30
Q04049
YOR345C
YOR345C
351 nt
0.81
□□□□□ -2.28
RAD30
Q04049
YOR302W
YOR302W
78 nt
0.8
□□□□□ -2.28
RAD30
Q04049
OST4
YDL232W
111 nt
0.79
□□□□□ -2.28
RAD30
Q04049
YER053C-A
YER053C-A
114 nt
0.79
□□□□□ -2.28
RAD30
Q04049
PRP42
YDR235W
1635 nt
0.78
□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
YCR038W-A
YCR038W-A
126 nt
0.77
□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
APQ12
YIL040W
417 nt
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□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
YSP1
YHR155W
3687 nt
0.76
□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
tN(GUU)Q
tN(GUU)Q
71 nt
0.75
□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
YJL127W-A
YJL127W-A
117 nt
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□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
YNL097C-B
YNL097C-B
123 nt
0.75
□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
YBR131C-A
YBR131C-A
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0.75
□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
UTP8
YGR128C
2142 nt
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□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
0.73
□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
TRS65
YGR166W
1683 nt
0.72
□□□□□ -2.29
RAD30
Q04049
YIL142C-A
YIL142C-A
333 nt
0.71
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
YPR159C-A
YPR159C-A
102 nt
0.71
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
SPG3
YDR504C
384 nt
0.69
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
RPM2
YML091C
3609 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
tF(GAA)B
tF(GAA)B
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0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
SNU13
YEL026W
381 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
PAU12
YGR294W
363 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
MLP1
YKR095W
5628 nt
0.68
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
YMR046W-A
YMR046W-A
129 nt
0.67
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
YMR158W-B
YMR158W-B
321 nt
0.67
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
UTP20
YBL004W
7482 nt
0.66
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
IQG1
YPL242C
4488 nt
0.66
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
PET111
YMR257C
2403 nt
0.66
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
PRP39
YML046W
1890 nt
0.65
□□□□□ -2.3
RAD30
Q04049
YEL014C
YEL014C
306 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
tT(AGU)B
tT(AGU)B
73 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
tT(AGU)C
tT(AGU)C
73 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
tT(AGU)D
tT(AGU)D
73 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
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tT(AGU)H
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0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
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tT(AGU)I1
73 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
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tT(AGU)I2
73 nt
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□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
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tT(AGU)J
73 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
tT(AGU)N1
tT(AGU)N1
73 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
tT(AGU)N2
tT(AGU)N2
73 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
tT(AGU)O1
tT(AGU)O1
73 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
tT(AGU)O2
tT(AGU)O2
73 nt
0.65
□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
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YLR232W
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RAD30
Q04049
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YMR272W-A
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RAD30
Q04049
QCR9
YGR183C
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□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
NNF2
YGR089W
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□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
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YMR160W
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□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
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tM(CAU)Q1
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□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
YJL182C
YJL182C
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□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
snR46
snR46
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□□□□□ -2.31
RAD30
Q04049
JLP2
YMR132C
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RAD30
Q04049
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YCR060W
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RAD30
Q04049
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YDR406W-A
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RAD30
Q04049
ULP2
YIL031W
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RAD30
Q04049
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YEL073C
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RAD30
Q04049
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YLL006W-A
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RAD30
Q04049
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YBL039C-A
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RAD30
Q04049
NIP1
YMR309C
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RAD30
Q04049
YGL182C
YGL182C
324 nt
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□□□□□ -2.32
RAD30
Q04049
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YLR342W-A
174 nt
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□□□□□ -2.32
RAD30
Q04049
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YBR072C-A
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RAD30
Q04049
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YOR192C-B
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RAD30
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YKL145W-A
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RAD30
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YOL014W
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RAD30
Q04049
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RAD30
Q04049
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RAD30
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RAD30
Q04049
UTP10
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RAD30
Q04049
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YDR371C-A
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RAD30
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Q04049
snR52
snR52
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RAD30
Q04049
BUL2
YML111W
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YOR381W-A
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YOR170W
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RAD30
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YOR314W-A
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Q04049
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RAD30
Q04049
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□□□□□ -2.35
RAD30
Q04049
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RAD30
Q04049
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YJL150W
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RAD30
Q04049
YOR186C-A
YOR186C-A
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□□□□□ -2.35
RAD30
Q04049
snR48
snR48
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RAD30
Q04049
CSE1
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RAD30
Q04049
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YBL100W-B
5313 nt
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□□□□□ -2.35
RAD30
Q04049
ESP1
YGR098C
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□□□□□ -2.35
RAD30
Q04049
tM(CAU)Q2
tM(CAU)Q2
78 nt
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□□□□□ -2.35
RAD30
Q04049
YDR210W
YDR210W
228 nt
0.3
□□□□□ -2.36
RAD30
Q04049
YHL015W-A
YHL015W-A
84 nt
0.29
□□□□□ -2.36
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