Protein–RNA interactions for Protein: P35736

YKL050C, Uncharacterized protein YKL050C, yeast

Predictions only

Length 922 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	P35736	RPL26B	YGR034W	384 nt		1.06	□□□□□ -2.24
YKL050C	P35736	BFR2	YDR299W	1605 nt		1.05	□□□□□ -2.24
YKL050C	P35736	YOR161W-A	YOR161W-A	81 nt		1.05	□□□□□ -2.24
YKL050C	P35736	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		1.04	□□□□□ -2.24
YKL050C	P35736	YGL123C-A	YGL123C-A	231 nt		1.04	□□□□□ -2.24
YKL050C	P35736	SCC2	YDR180W	4482 nt		1.03	□□□□□ -2.24
YKL050C	P35736	YLR282C	YLR282C	342 nt		1.03	□□□□□ -2.24
YKL050C	P35736	snR190	snR190	190 nt		1.03	□□□□□ -2.24
YKL050C	P35736	PRP16	YKR086W	3216 nt		1.03	□□□□□ -2.24
YKL050C	P35736	YPR117W	YPR117W	7470 nt		1.02	□□□□□ -2.25
YKL050C	P35736	PMP1	YCR024C-A	123 nt		1.02	□□□□□ -2.25
YKL050C	P35736	BIR1	YJR089W	2865 nt		1.02	□□□□□ -2.25
YKL050C	P35736	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		1.01	□□□□□ -2.25
YKL050C	P35736	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		1.01	□□□□□ -2.25
YKL050C	P35736	snR46	snR46	197 nt		1.01	□□□□□ -2.25
YKL050C	P35736	YEL014C	YEL014C	306 nt		1	□□□□□ -2.25
YKL050C	P35736	COX5B	YIL111W	456 nt		1	□□□□□ -2.25
YKL050C	P35736	RKR1	YMR247C	4689 nt		0.99	□□□□□ -2.25
YKL050C	P35736	YJL150W	YJL150W	303 nt		0.96	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YJL182C	YJL182C	318 nt		0.96	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	SEC8	YPR055W	3198 nt		0.95	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YLR041W	YLR041W	321 nt		0.95	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		0.95	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YKL100W-A	YKL100W-A	90 nt		0.94	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YML002W	YML002W	2214 nt		0.94	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YIL142C-A	YIL142C-A	333 nt		0.93	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	snR52	snR52	92 nt		0.93	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	PRP39	YML046W	1890 nt		0.92	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	FYV10	YIL097W	1551 nt		0.92	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YMR160W	YMR160W	2451 nt		0.92	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	PRP5	YBR237W	2550 nt		0.92	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		0.91	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YNL198C	YNL198C	303 nt		0.91	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	YOL014W	YOL014W	375 nt		0.91	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	PRP42	YDR235W	1635 nt		0.9	□□□□□ -2.26
YKL050C	P35736	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		0.9	□□□□□ -2.27
YKL050C	P35736	YNL337W	YNL337W	255 nt		0.9	□□□□□ -2.27
YKL050C	P35736	CHS6	YJL099W	2241 nt		0.89	□□□□□ -2.27
YKL050C	P35736	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		0.86	□□□□□ -2.27
YKL050C	P35736	YEL073C	YEL073C	324 nt		0.85	□□□□□ -2.27
YKL050C	P35736	OST4	YDL232W	111 nt		0.84	□□□□□ -2.27
YKL050C	P35736	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		0.84	□□□□□ -2.27
YKL050C	P35736	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		0.83	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	UTP8	YGR128C	2142 nt		0.83	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	TRS65	YGR166W	1683 nt		0.82	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	TAH1	YCR060W	336 nt		0.82	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		0.82	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	SEC1	YDR164C	2175 nt		0.81	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	YGL182C	YGL182C	324 nt		0.8	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	SNU13	YEL026W	381 nt		0.79	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	YGR151C	YGR151C	336 nt		0.79	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	THO2	YNL139C	4794 nt		0.79	□□□□□ -2.28
YKL050C	P35736	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		0.77	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YLR232W	YLR232W	348 nt		0.77	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		0.77	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		0.76	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YOR225W	YOR225W	330 nt		0.76	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YPR159C-A	YPR159C-A	102 nt		0.76	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	LTE1	YAL024C	4308 nt		0.76	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YJL127W-A	YJL127W-A	117 nt		0.75	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YSP1	YHR155W	3687 nt		0.74	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	Q0032	Q0032	291 nt		0.74	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YDR544C	YDR544C	429 nt		0.73	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	ULP2	YIL031W	3105 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YOR192C-B	YOR192C-B	5313 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)B	tT(AGU)B	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)C	tT(AGU)C	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)D	tT(AGU)D	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)H	tT(AGU)H	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)I1	tT(AGU)I1	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)I2	tT(AGU)I2	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)J	tT(AGU)J	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)N1	tT(AGU)N1	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)N2	tT(AGU)N2	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)O1	tT(AGU)O1	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	tT(AGU)O2	tT(AGU)O2	73 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YOR170W	YOR170W	306 nt		0.72	□□□□□ -2.29
YKL050C	P35736	YNL338W	YNL338W	159 nt		0.71	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	AI1	Q0050	2505 nt		0.7	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	YMR272W-A	YMR272W-A	114 nt		0.7	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	YBL053W	YBL053W	375 nt		0.69	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	IQG1	YPL242C	4488 nt		0.68	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	snR48	snR48	113 nt		0.68	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	NNF2	YGR089W	2811 nt		0.68	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	BEM3	YPL115C	3387 nt		0.68	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	BUL2	YML111W	2763 nt		0.66	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		0.66	□□□□□ -2.3
YKL050C	P35736	COG6	YNL041C	2520 nt		0.65	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	UTP10	YJL109C	5310 nt		0.65	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		0.65	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	SDH6	YDR379C-A	240 nt		0.64	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		0.64	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		0.64	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	PET111	YMR257C	2403 nt		0.63	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		0.63	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	YOR102W	YOR102W	351 nt		0.63	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		0.63	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	NIP1	YMR309C	2439 nt		0.62	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	RPS26A	YGL189C	360 nt		0.61	□□□□□ -2.31
YKL050C	P35736	FMP27	YLR454W	7887 nt		0.61	□□□□□ -2.31

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