Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

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Length 1,114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 RPS25BYLR333C 327 nt0.79□□□□□ -2.28
SMC6Q12749 UTP20YBL004W 7482 nt0.79□□□□□ -2.28
SMC6Q12749 RPL35AYDL191W 363 nt0.78□□□□□ -2.28
SMC6Q12749 RKR1YMR247C 4689 nt0.78□□□□□ -2.28
SMC6Q12749 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.77□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.77□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 RPL26BYGR034W 384 nt0.76□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.76□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 ASE1YOR058C 2658 nt0.76□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 QCR9YGR183C 201 nt0.75□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 YPL225WYPL225W 441 nt0.75□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 NPR2YEL062W 1848 nt0.74□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.74□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 CHS6YJL099W 2241 nt0.74□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 YMR160WYMR160W 2451 nt0.74□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 ECM12YHR021W-A 456 nt0.73□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.73□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 YMR321CYMR321C 318 nt0.73□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 BEM3YPL115C 3387 nt0.72□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 YOR218CYOR218C 420 nt0.72□□□□□ -2.29
SMC6Q12749 YFL019CYFL019C 354 nt0.71□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 TAR1YLR154W-C 375 nt0.71□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 YNL211CYNL211C 261 nt0.71□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.7□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.7□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 SEC8YPR055W 3198 nt0.69□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.69□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 HAL9YOL089C 3093 nt0.69□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.67□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 IQG1YPL242C 4488 nt0.67□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 YSP1YHR155W 3687 nt0.67□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 FYV10YIL097W 1551 nt0.66□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.66□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.66□□□□□ -2.3
SMC6Q12749 SGF11YPL047W 300 nt0.65□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YML002WYML002W 2214 nt0.64□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YDR048CYDR048C 315 nt0.64□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YOL014WYOL014W 375 nt0.64□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 SSS1YDR086C 243 nt0.63□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YPR012WYPR012W 255 nt0.63□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.62□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.61□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.61□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.61□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 COG8YML071C 1824 nt0.61□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 PRP5YBR237W 2550 nt0.6□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.6□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.59□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.59□□□□□ -2.31
SMC6Q12749 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 MLP1YKR095W 5628 nt0.59□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 RPS27BYHR021C 249 nt0.58□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 HTL1YCR020W-B 237 nt0.57□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.57□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 MYO1YHR023W 5787 nt0.56□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.56□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 OST4YDL232W 111 nt0.56□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 COX5BYIL111W 456 nt0.56□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 snR190snR190 190 nt0.56□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 CSE2YNR010W 450 nt0.55□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.54□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 PRP42YDR235W 1635 nt0.53□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 MLP2YIL149C 5040 nt0.53□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 YDR102CYDR102C 333 nt0.53□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.53□□□□□ -2.32
SMC6Q12749 ULP2YIL031W 3105 nt0.52□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 FMP27YLR454W 7887 nt0.52□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 YAF9YNL107W 681 nt0.52□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.52□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 PET111YMR257C 2403 nt0.52□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 VIK1YPL253C 1944 nt0.5□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 TRS65YGR166W 1683 nt0.5□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.5□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 YPR197CYPR197C 564 nt0.5□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.49□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 SBH1YER087C-B 249 nt0.47□□□□□ -2.33
SMC6Q12749 snR60snR60 104 nt0.46□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.46□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 YIL032CYIL032C 357 nt0.46□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 YKL136WYKL136W 399 nt0.45□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 YCR022CYCR022C 345 nt0.44□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 YLR282CYLR282C 342 nt0.44□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 YOR345CYOR345C 351 nt0.44□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 AI1Q0050 2505 nt0.43□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.42□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 ABF2YMR072W 552 nt0.42□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.41□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 ATP6Q0085 780 nt0.41□□□□□ -2.34
SMC6Q12749 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.4□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 BIR1YJR089W 2865 nt0.39□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 YFL063WYFL063W 456 nt0.39□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 ULI1YFR026C 510 nt0.39□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 YGL149WYGL149W 306 nt0.39□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.39□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.38□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 YNL028WYNL028W 318 nt0.38□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 snR36snR36 182 nt0.38□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 COY1YKL179C 2040 nt0.37□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 BLI1YKL061W 342 nt0.37□□□□□ -2.35
SMC6Q12749 STE5YDR103W 2754 nt0.37□□□□□ -2.35
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