Protein–RNA interactions for Protein: Q12499

NOP58, Nucleolar protein 58, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP58Q12499 OLI1Q0130 231 nt1.16□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 YNL028WYNL028W 318 nt1.16□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.16□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 RAD61YDR014W 1944 nt1.15□□□□□ -2.22
NOP58Q12499 SMC1YFL008W 3678 nt1.15□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 MCM10YIL150C 1716 nt1.14□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.13□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.13□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.13□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 IES4YOR189W 351 nt1.13□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 SGF11YPL047W 300 nt1.13□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 YGR130CYGR130C 2451 nt1.13□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 YGR069WYGR069W 336 nt1.12□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 YOR015WYOR015W 360 nt1.11□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 KAP120YPL125W 3099 nt1.1□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.09□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 CMC4YMR194C-B 222 nt1.09□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 YNL211CYNL211C 261 nt1.09□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.09□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.09□□□□□ -2.23
NOP58Q12499 NOP9YJL010C 2001 nt1.09□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 YDL196WYDL196W 330 nt1.08□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 ISD11YER048W-A 285 nt1.08□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 IML1YJR138W 4755 nt1.08□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 SIP4YJL089W 2490 nt1.07□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.06□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.06□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.06□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 YPL044CYPL044C 549 nt1.06□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 PAA1YDR071C 576 nt1.05□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.05□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 YGL052WYGL052W 306 nt1.04□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 YOR282WYOR282W 321 nt1.04□□□□□ -2.24
NOP58Q12499 BFR2YDR299W 1605 nt1.02□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 ASE1YOR058C 2658 nt1.02□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 YPR092WYPR092W 306 nt1.02□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 YER181CYER181C 324 nt1.01□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.01□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.01□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 TTI1YKL033W 3117 nt1.01□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 PMP1YCR024C-A 123 nt0.99□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 RPL26BYGR034W 384 nt0.99□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.99□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 YDL073WYDL073W 2955 nt0.99□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.98□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 BUD3YCL014W 4911 nt0.97□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.97□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 PAU24YBR301W 363 nt0.97□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 RKR1YMR247C 4689 nt0.97□□□□□ -2.25
NOP58Q12499 snR74snR74 88 nt0.96□□□□□ -2.26
NOP58Q12499 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.96□□□□□ -2.26
NOP58Q12499 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.94□□□□□ -2.26
NOP58Q12499 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.93□□□□□ -2.26
NOP58Q12499 YPR117WYPR117W 7470 nt0.93□□□□□ -2.26
NOP58Q12499 PRP16YKR086W 3216 nt0.93□□□□□ -2.26
NOP58Q12499 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP58Q12499 snR49snR49 165 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP58Q12499 snR190snR190 190 nt0.9□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.89□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 COY1YKL179C 2040 nt0.89□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 SEC8YPR055W 3198 nt0.89□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 NPR2YEL062W 1848 nt0.88□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 snR55snR55 98 nt0.88□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.88□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.87□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 YLR282CYLR282C 342 nt0.87□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.86□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 CHS6YJL099W 2241 nt0.86□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 SEC1YDR164C 2175 nt0.85□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.84□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 PAM16YJL104W 450 nt0.84□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.84□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.84□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.84□□□□□ -2.27
NOP58Q12499 YKU70YMR284W 1809 nt0.83□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 YCR022CYCR022C 345 nt0.83□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 YGL041CYGL041C 204 nt0.83□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.83□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 COX5BYIL111W 456 nt0.83□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 RPS30BYOR182C 192 nt0.83□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.83□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 COX12YLR038C 252 nt0.82□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 FYV10YIL097W 1551 nt0.82□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 PRP5YBR237W 2550 nt0.81□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 HAL9YOL089C 3093 nt0.81□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 YML002WYML002W 2214 nt0.81□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 ULI1YFR026C 510 nt0.8□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 BLI1YKL061W 342 nt0.8□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 ABF2YMR072W 552 nt0.8□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.79□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.79□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.79□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 UBP3YER151C 2739 nt0.78□□□□□ -2.28
NOP58Q12499 YOR345CYOR345C 351 nt0.77□□□□□ -2.29
NOP58Q12499 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.77□□□□□ -2.29
NOP58Q12499 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.76□□□□□ -2.29
NOP58Q12499 OST4YDL232W 111 nt0.75□□□□□ -2.29
NOP58Q12499 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.75□□□□□ -2.29
NOP58Q12499 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.2 ms