Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 YOR019WYOR019W 2193 nt1.77□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 PMP2YEL017C-A 132 nt1.77□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.77□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.77□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 GYP5YPL249C 2685 nt1.77□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 PRP5YBR237W 2550 nt1.77□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YLR419WYLR419W 4308 nt1.75□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 CMC4YMR194C-B 222 nt1.75□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.75□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YBR099CYBR099C 384 nt1.75□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YJR039WYJR039W 3366 nt1.75□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 TTI1YKL033W 3117 nt1.75□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 NAB6YML117W 3405 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YLL054CYLL054C 2532 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YDR544CYDR544C 429 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 APL1YJR005W 2103 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YNL211CYNL211C 261 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 MEC1YBR136W 7107 nt1.74□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 SFB2YNL049C 2631 nt1.73□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 SAC3YDR159W 3906 nt1.73□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.73□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 YMR326CYMR326C 309 nt1.73□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 SPO24YPR036W-A 204 nt1.73□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 ATG11YPR049C 3537 nt1.73□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 ADR1YDR216W 3972 nt1.72□□□□□ -2.13
TAF3Q12297 NUP157YER105C 4176 nt1.71□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 TDA9YML081W 3756 nt1.71□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 YDL206WYDL206W 2289 nt1.7□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 RAD50YNL250W 3939 nt1.7□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 PEP1YBL017C 4740 nt1.69□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 CHS6YJL099W 2241 nt1.68□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 VPS15YBR097W 4365 nt1.68□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 UTP8YGR128C 2142 nt1.67□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.67□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 OST4YDL232W 111 nt1.66□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 YGL182CYGL182C 324 nt1.66□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.66□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 CFT1YDR301W 4074 nt1.66□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 SMC1YFL008W 3678 nt1.65□□□□□ -2.14
TAF3Q12297 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.65□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 COA6YMR244C-A 315 nt1.65□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 SMC4YLR086W 4257 nt1.65□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 TBS1YBR150C 3285 nt1.64□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 SOM1YEL059C-A 225 nt1.64□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.64□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 YHR217CYHR217C 462 nt1.63□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 UFD2YDL190C 2886 nt1.63□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.62□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 snR14snR14 160 nt1.62□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 YPP1YGR198W 2454 nt1.61□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 RSM22YKL155C 1887 nt1.61□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 MON2YNL297C 4911 nt1.61□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 SLX4YLR135W 2247 nt1.61□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 snR61snR61 90 nt1.61□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 SKI3YPR189W 4299 nt1.61□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 BFR2YDR299W 1605 nt1.6□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 QCR9YGR183C 201 nt1.6□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 YLR282CYLR282C 342 nt1.6□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 CHS1YNL192W 3396 nt1.6□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 YOR093CYOR093C 4947 nt1.59□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.59□□□□□ -2.15
TAF3Q12297 MMS4YBR098W 2076 nt1.59□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 SPC110YDR356W 2835 nt1.58□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 EMC5YIL027C 426 nt1.58□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 YLL020CYLL020C 306 nt1.58□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 KIP1YBL063W 3336 nt1.58□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 SXM1YDR395W 2835 nt1.58□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 NUT1YGL151W 3399 nt1.57□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.57□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 STB6YKL072W 2301 nt1.57□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 YAR009CYAR009C 3591 nt1.57□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 TAH1YCR060W 336 nt1.56□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 GEA2YEL022W 4380 nt1.56□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.55□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.55□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 snR39BsnR39B 96 nt1.55□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 CCH1YGR217W 6120 nt1.54□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 COX5BYIL111W 456 nt1.54□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.54□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 PMD1YER132C 5262 nt1.54□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 POL5YEL055C 3069 nt1.53□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 SSK2YNR031C 4740 nt1.53□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 KCS1YDR017C 3153 nt1.53□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 FYV8YGR196C 2454 nt1.53□□□□□ -2.16
TAF3Q12297 SEC21YNL287W 2808 nt1.53□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 PET127YOR017W 2403 nt1.52□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.52□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 YML002WYML002W 2214 nt1.51□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 STO1YMR125W 2586 nt1.51□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.51□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 ALY2YJL084C 3141 nt1.51□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 PIK1YNL267W 3201 nt1.5□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 PAN2YGL094C 3348 nt1.5□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 EAF1YDR359C 2949 nt1.5□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.49□□□□□ -2.17
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