Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 CMC4YMR194C-B 222 nt0.93□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 SPT7YBR081C 3999 nt0.93□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.92□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.92□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.92□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.92□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.92□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.92□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.92□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.92□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.92□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 NOP9YJL010C 2001 nt0.91□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.91□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.91□□□□□ -2.26
TPT1Q12272 YGL052WYGL052W 306 nt0.9□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.9□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.9□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YPL044CYPL044C 549 nt0.9□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 KAP120YPL125W 3099 nt0.89□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 SCC2YDR180W 4482 nt0.89□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 REV3YPL167C 4515 nt0.89□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 BFR2YDR299W 1605 nt0.89□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 BUD3YCL014W 4911 nt0.88□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 ISD11YER048W-A 285 nt0.88□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YER181CYER181C 324 nt0.88□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YPR092WYPR092W 306 nt0.88□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 RKR1YMR247C 4689 nt0.88□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 snR74snR74 88 nt0.87□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.87□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 ASE1YOR058C 2658 nt0.86□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 PAA1YDR071C 576 nt0.86□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.86□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.86□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.85□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 BEM2YER155C 6504 nt0.85□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 DOP1YDR141C 5097 nt0.84□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 PMP1YCR024C-A 123 nt0.84□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.84□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 YOR282WYOR282W 321 nt0.84□□□□□ -2.27
TPT1Q12272 RPL26BYGR034W 384 nt0.82□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.82□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.82□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 MSH3YCR092C 3057 nt0.81□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 YGR130CYGR130C 2451 nt0.8□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.8□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 snR49snR49 165 nt0.8□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 NUP192YJL039C 5052 nt0.8□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 YPR117WYPR117W 7470 nt0.79□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 YDL073WYDL073W 2955 nt0.79□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.78□□□□□ -2.28
TPT1Q12272 COY1YKL179C 2040 nt0.77□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 YGL041CYGL041C 204 nt0.77□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.76□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 snR190snR190 190 nt0.76□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 NPR2YEL062W 1848 nt0.75□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 snR55snR55 98 nt0.75□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 YCR022CYCR022C 345 nt0.75□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.75□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.74□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.74□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 YLR282CYLR282C 342 nt0.74□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 CHS6YJL099W 2241 nt0.73□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 RPS30BYOR182C 192 nt0.73□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.73□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 SIP4YJL089W 2490 nt0.73□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 SEC8YPR055W 3198 nt0.72□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.72□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.72□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.72□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.72□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 PRP16YKR086W 3216 nt0.72□□□□□ -2.29
TPT1Q12272 TTI1YKL033W 3117 nt0.71□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.71□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.71□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.71□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 YML002WYML002W 2214 nt0.7□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 COX12YLR038C 252 nt0.7□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 ABF2YMR072W 552 nt0.7□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 YOR345CYOR345C 351 nt0.7□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 YKU70YMR284W 1809 nt0.7□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 snR80snR80 171 nt0.69□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 ULI1YFR026C 510 nt0.69□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 FYV10YIL097W 1551 nt0.69□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 PRP5YBR237W 2550 nt0.68□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.68□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 COX5BYIL111W 456 nt0.68□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 BLI1YKL061W 342 nt0.68□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.68□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 PAU24YBR301W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 SEC1YDR164C 2175 nt0.67□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.66□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
TPT1Q12272 snR8snR8 190 nt0.65□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.65□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 OST4YDL232W 111 nt0.64□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 YOR302WYOR302W 78 nt0.64□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 IML1YJR138W 4755 nt0.63□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 LTE1YAL024C 4308 nt0.63□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 YDR366CYDR366C 399 nt0.63□□□□□ -2.31
TPT1Q12272 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80 ms