Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 HUG1YML058W-A 207 nt1.42□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 AHC1YOR023C 1701 nt1.42□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 WAR1YML076C 2835 nt1.42□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 STB6YKL072W 2301 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 CDC39YCR093W 6327 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 ECM12YHR021W-A 456 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 CLU1YMR012W 3834 nt1.4□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 SMC1YFL008W 3678 nt1.39□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 LAA1YJL207C 6045 nt1.39□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 snR74snR74 88 nt1.39□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 CDC36YDL165W 576 nt1.39□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.37□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 SGF11YPL047W 300 nt1.37□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 RPL33BYOR234C 324 nt1.36□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 NUP157YER105C 4176 nt1.36□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 NPR2YEL062W 1848 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 OLI1Q0130 231 nt1.34□□□□□ -2.19
RRP6Q12149 ROM2YLR371W 4071 nt1.34□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 GEA2YEL022W 4380 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 RAD9YDR217C 3930 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 SPG3YDR504C 384 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 IML1YJR138W 4755 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 YKU70YMR284W 1809 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 YOR302WYOR302W 78 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 JLP2YMR132C 627 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP6Q12149 BUD3YCL014W 4911 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 YDL196WYDL196W 330 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 CMC4YMR194C-B 222 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 YNL211CYNL211C 261 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 YPL044CYPL044C 549 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 NOP9YJL010C 2001 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 PAA1YDR071C 576 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 BLI1YKL061W 342 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 ISD11YER048W-A 285 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 APL1YJR005W 2103 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 NST1YNL091W 3723 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP6Q12149 ULI1YFR026C 510 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 YOR345CYOR345C 351 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 DOP1YDR141C 5097 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 KAP120YPL125W 3099 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 APQ12YIL040W 417 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 SCC2YDR180W 4482 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 RPL26BYGR034W 384 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 PAM16YJL104W 450 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 SIP4YJL089W 2490 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 TTI1YKL033W 3117 nt1.16□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 SPT7YBR081C 3999 nt1.16□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 RPS30BYOR182C 192 nt1.16□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 VAM6YDL077C 3150 nt1.15□□□□□ -2.22
RRP6Q12149 YJR029WYJR029W 5268 nt1.15□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.15□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YEL014CYEL014C 306 nt1.15□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 COY1YKL179C 2040 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 COX12YLR038C 252 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 BEM2YER155C 6504 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 BFR2YDR299W 1605 nt1.12□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 PMP1YCR024C-A 123 nt1.12□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.12□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 ASE1YOR058C 2658 nt1.12□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.11□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.11□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.1□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.09□□□□□ -2.23
RRP6Q12149 UBP3YER151C 2739 nt1.09□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 YLR282CYLR282C 342 nt1.08□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 snR190snR190 190 nt1.07□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 PAU12YGR294W 363 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 PAU24YBR301W 363 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 snR52snR52 92 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 SEC8YPR055W 3198 nt1.04□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.04□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
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