Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt3.06□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 CTR9YOL145C 3234 nt3.06□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 RSM22YKL155C 1887 nt3.05□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 TBS1YBR150C 3285 nt3.04□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 BPH1YCR032W 6504 nt3.04□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 POL5YEL055C 3069 nt3.04□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 FRK1YPL141C 2598 nt3.03□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 YLR232WYLR232W 348 nt3.03□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 COA6YMR244C-A 315 nt3.03□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 snR53snR53 91 nt3.03□□□□□ -1.92
NOP53Q12080 TRL1YJL087C 2484 nt3.02□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 RAV1YJR033C 4074 nt3.02□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt3.02□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 RPS29AYLR388W 171 nt3.02□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt3.02□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 TOP2YNL088W 4287 nt3.02□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 IRE1YHR079C 3348 nt3.01□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 FAR11YNL127W 2862 nt3.01□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 SEC21YNL287W 2808 nt3.01□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 RTP1YMR185W 2946 nt3□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 SYH1YPL105C 2550 nt3□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 RPS26AYGL189C 360 nt2.99□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 SEY1YOR165W 2331 nt2.99□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 RTT107YHR154W 3213 nt2.98□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 CDC60YPL160W 3273 nt2.98□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 YML002WYML002W 2214 nt2.98□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 PDR11YIL013C 4236 nt2.98□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 PET309YLR067C 2898 nt2.98□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 KOG1YHR186C 4674 nt2.98□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 PSD2YGR170W 3417 nt2.97□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.97□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 YOR055WYOR055W 435 nt2.97□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 CSF1YLR087C 8877 nt2.97□□□□□ -1.93
NOP53Q12080 MSB1YOR188W 3414 nt2.96□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 YJR039WYJR039W 3366 nt2.96□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 HIR3YJR140C 4947 nt2.96□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 NUP170YBL079W 4509 nt2.95□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 DNF1YER166W 4716 nt2.95□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 SPO24YPR036W-A 204 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 UFD4YKL010C 4452 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 SPF1YEL031W 3648 nt2.94□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.93□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 YOL098CYOL098C 3114 nt2.92□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 FYV10YIL097W 1551 nt2.91□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 GLG1YKR058W 1851 nt2.9□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 TOF1YNL273W 3717 nt2.9□□□□□ -1.94
NOP53Q12080 snR47snR47 99 nt2.9□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 KRE33YNL132W 3171 nt2.9□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 VPS13YLL040C 9435 nt2.89□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 ARP8YOR141C 2646 nt2.89□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 TIM9YEL020W-A 264 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 SMC1YFL008W 3678 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 SFB2YNL049C 2631 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 GCN2YDR283C 4980 nt2.87□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 YLR041WYLR041W 321 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 YLR419WYLR419W 4308 nt2.86□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 snR64snR64 101 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 ORC3YLL004W 1851 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP53Q12080 SCD5YOR329C 2619 nt2.84□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 IRA2YOL081W 9240 nt2.83□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 MSH6YDR097C 3729 nt2.83□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 BNR1YIL159W 4128 nt2.83□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 ALY2YJL084C 3141 nt2.82□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 REV3YPL167C 4515 nt2.82□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 SVL3YPL032C 2478 nt2.82□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 TRM3YDL112W 4311 nt2.82□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 INO80YGL150C 4470 nt2.81□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 YMR045CYMR045C 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 TRA1YHR099W 11235 nt2.8□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 GYP5YPL249C 2685 nt2.8□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 RAD50YNL250W 3939 nt2.8□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 ASE1YOR058C 2658 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 RGA1YOR127W 3024 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 YAR009CYAR009C 3591 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 snR50snR50 90 nt2.78□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 NUT1YGL151W 3399 nt2.78□□□□□ -1.96
NOP53Q12080 UTP21YLR409C 2820 nt2.78□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.77□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 MMS4YBR098W 2076 nt2.77□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.76□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 PAN2YGL094C 3348 nt2.76□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 RPL26BYGR034W 384 nt2.75□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 UBR2YLR024C 5619 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 RTT101YJL047C 2529 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 YPR097WYPR097W 3222 nt2.73□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 snR190snR190 190 nt2.73□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 UTP22YGR090W 3714 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 SEC10YLR166C 2616 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP53Q12080 PIK1YNL267W 3201 nt2.71□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 TUS1YLR425W 3924 nt2.71□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 NOP9YJL010C 2001 nt2.7□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 AZF1YOR113W 2745 nt2.7□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 snR14snR14 160 nt2.69□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 USO1YDL058W 5373 nt2.69□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 WAR1YML076C 2835 nt2.69□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 MYO2YOR326W 4725 nt2.68□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 UBP2YOR124C 3819 nt2.68□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.68□□□□□ -1.98
NOP53Q12080 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt2.67□□□□□ -1.98
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