Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.71□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.71□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YMR321CYMR321C 318 nt0.7□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 QCR9YGR183C 201 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 SGF11YPL047W 300 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 UBP3YER151C 2739 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 LTE1YAL024C 4308 nt0.69□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.68□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YSP1YHR155W 3687 nt0.68□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YOR218CYOR218C 420 nt0.67□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YPR012WYPR012W 255 nt0.67□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 NHP2YDL208W 471 nt0.66□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.66□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 YML002WYML002W 2214 nt0.66□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 FYV10YIL097W 1551 nt0.66□□□□□ -2.3
CIK1Q01649 SEC8YPR055W 3198 nt0.65□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.64□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 YDR102CYDR102C 333 nt0.64□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.64□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 COG8YML071C 1824 nt0.64□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 HAL9YOL089C 3093 nt0.63□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 UTP10YJL109C 5310 nt0.63□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 IQG1YPL242C 4488 nt0.62□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.61□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 YPR197CYPR197C 564 nt0.61□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 PRP5YBR237W 2550 nt0.6□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 snR60snR60 104 nt0.6□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 RPS27BYHR021C 249 nt0.6□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.6□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.59□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 COX5BYIL111W 456 nt0.59□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.59□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 YOL014WYOL014W 375 nt0.59□□□□□ -2.31
CIK1Q01649 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YMR160WYMR160W 2451 nt0.58□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 BEM3YPL115C 3387 nt0.57□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 GIM4YEL003W 336 nt0.57□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 snR190snR190 190 nt0.57□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 HTL1YCR020W-B 237 nt0.56□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.56□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.55□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 OST4YDL232W 111 nt0.55□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 CSE2YNR010W 450 nt0.55□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 snR36snR36 182 nt0.55□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 VIK1YPL253C 1944 nt0.55□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 HMRA1YCR097W 381 nt0.54□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YIL032CYIL032C 357 nt0.54□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.54□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YOR015WYOR015W 360 nt0.54□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.53□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 YFL032WYFL032W 321 nt0.53□□□□□ -2.32
CIK1Q01649 PRP42YDR235W 1635 nt0.53□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.52□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.52□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 snR56snR56 88 nt0.51□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.51□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 PET111YMR257C 2403 nt0.5□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.5□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.5□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.5□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YFL063WYFL063W 456 nt0.49□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.49□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YDR413CYDR413C 576 nt0.48□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YER097WYER097W 330 nt0.48□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YOR345CYOR345C 351 nt0.48□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YPR092WYPR092W 306 nt0.48□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YKL136WYKL136W 399 nt0.47□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.47□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 COY1YKL179C 2040 nt0.47□□□□□ -2.33
CIK1Q01649 SBH1YER087C-B 249 nt0.46□□□□□ -2.34
CIK1Q01649 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.46□□□□□ -2.34
CIK1Q01649 YLR282CYLR282C 342 nt0.46□□□□□ -2.34
CIK1Q01649 UTP20YBL004W 7482 nt0.45□□□□□ -2.34
CIK1Q01649 ATP6Q0085 780 nt0.45□□□□□ -2.34
CIK1Q01649 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.45□□□□□ -2.34
CIK1Q01649 ULI1YFR026C 510 nt0.45□□□□□ -2.34
CIK1Q01649 MLP2YIL149C 5040 nt0.44□□□□□ -2.34
CIK1Q01649 MLP1YKR095W 5628 nt0.44□□□□□ -2.34
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