Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 NUP145YGL092W 3954 nt1.23□□□□□ -2.21
HEF3P53978 YCR022CYCR022C 345 nt1.23□□□□□ -2.21
HEF3P53978 RAD9YDR217C 3930 nt1.22□□□□□ -2.21
HEF3P53978 SEC3YER008C 4011 nt1.22□□□□□ -2.21
HEF3P53978 YJR029WYJR029W 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
HEF3P53978 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
HEF3P53978 IES4YOR189W 351 nt1.21□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YOR282WYOR282W 321 nt1.21□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.2□□□□□ -2.22
HEF3P53978 ECM12YHR021W-A 456 nt1.2□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.2□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YOR015WYOR015W 360 nt1.2□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.2□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.2□□□□□ -2.22
HEF3P53978 WAR1YML076C 2835 nt1.19□□□□□ -2.22
HEF3P53978 SMC1YFL008W 3678 nt1.19□□□□□ -2.22
HEF3P53978 PAU12YGR294W 363 nt1.19□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YBR064WYBR064W 429 nt1.19□□□□□ -2.22
HEF3P53978 PAU24YBR301W 363 nt1.19□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YGL052WYGL052W 306 nt1.18□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.18□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.17□□□□□ -2.22
HEF3P53978 EAF1YDR359C 2949 nt1.17□□□□□ -2.22
HEF3P53978 MCM10YIL150C 1716 nt1.17□□□□□ -2.22
HEF3P53978 VAM6YDL077C 3150 nt1.16□□□□□ -2.22
HEF3P53978 YGL041CYGL041C 204 nt1.16□□□□□ -2.22
HEF3P53978 UTP20YBL004W 7482 nt1.16□□□□□ -2.22
HEF3P53978 NUP157YER105C 4176 nt1.16□□□□□ -2.22
HEF3P53978 STB6YKL072W 2301 nt1.16□□□□□ -2.22
HEF3P53978 BUD3YCL014W 4911 nt1.15□□□□□ -2.23
HEF3P53978 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.15□□□□□ -2.23
HEF3P53978 PAM16YJL104W 450 nt1.15□□□□□ -2.23
HEF3P53978 SGF11YPL047W 300 nt1.15□□□□□ -2.23
HEF3P53978 CDC39YCR093W 6327 nt1.14□□□□□ -2.23
HEF3P53978 YPR092WYPR092W 306 nt1.14□□□□□ -2.23
HEF3P53978 snR49snR49 165 nt1.14□□□□□ -2.23
HEF3P53978 GEA2YEL022W 4380 nt1.13□□□□□ -2.23
HEF3P53978 OLI1Q0130 231 nt1.13□□□□□ -2.23
HEF3P53978 YDR366CYDR366C 399 nt1.12□□□□□ -2.23
HEF3P53978 APL1YJR005W 2103 nt1.12□□□□□ -2.23
HEF3P53978 snR80snR80 171 nt1.1□□□□□ -2.23
HEF3P53978 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.1□□□□□ -2.23
HEF3P53978 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.09□□□□□ -2.23
HEF3P53978 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.09□□□□□ -2.23
HEF3P53978 snR55snR55 98 nt1.08□□□□□ -2.24
HEF3P53978 snR8snR8 190 nt1.08□□□□□ -2.24
HEF3P53978 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.08□□□□□ -2.24
HEF3P53978 CMC4YMR194C-B 222 nt1.08□□□□□ -2.24
HEF3P53978 YNL211CYNL211C 261 nt1.08□□□□□ -2.24
HEF3P53978 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.08□□□□□ -2.24
HEF3P53978 snR74snR74 88 nt1.07□□□□□ -2.24
HEF3P53978 QCR9YGR183C 201 nt1.07□□□□□ -2.24
HEF3P53978 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.07□□□□□ -2.24
HEF3P53978 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.07□□□□□ -2.24
HEF3P53978 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.06□□□□□ -2.24
HEF3P53978 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.06□□□□□ -2.24
HEF3P53978 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.06□□□□□ -2.24
HEF3P53978 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.06□□□□□ -2.24
HEF3P53978 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
HEF3P53978 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.06□□□□□ -2.24
HEF3P53978 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.06□□□□□ -2.24
HEF3P53978 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
HEF3P53978 NOP9YJL010C 2001 nt1.05□□□□□ -2.24
HEF3P53978 PAA1YDR071C 576 nt1.05□□□□□ -2.24
HEF3P53978 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.04□□□□□ -2.24
HEF3P53978 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.04□□□□□ -2.24
HEF3P53978 YPL044CYPL044C 549 nt1.04□□□□□ -2.24
HEF3P53978 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.03□□□□□ -2.24
HEF3P53978 ABF2YMR072W 552 nt1.03□□□□□ -2.24
HEF3P53978 NPR2YEL062W 1848 nt1.02□□□□□ -2.25
HEF3P53978 ISD11YER048W-A 285 nt1.02□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.02□□□□□ -2.25
HEF3P53978 KAP120YPL125W 3099 nt1.02□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.01□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YDL196WYDL196W 330 nt1□□□□□ -2.25
HEF3P53978 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
HEF3P53978 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
HEF3P53978 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
HEF3P53978 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
HEF3P53978 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
HEF3P53978 RPL26BYGR034W 384 nt0.99□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.99□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YKU70YMR284W 1809 nt0.99□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YDL073WYDL073W 2955 nt0.98□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.97□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.97□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YOR302WYOR302W 78 nt0.97□□□□□ -2.25
HEF3P53978 YMR160WYMR160W 2451 nt0.96□□□□□ -2.26
HEF3P53978 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
HEF3P53978 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
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