Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

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Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 snR189snR189 189 nt-2.17□□□□□ -2.76
SSK2P53599 CMS1YLR003C 876 nt-2.18□□□□□ -2.76
SSK2P53599 BER1YLR412W 825 nt-2.18□□□□□ -2.76
SSK2P53599 HUR1YGL168W 333 nt-2.19□□□□□ -2.76
SSK2P53599 SPO12YHR152W 522 nt-2.19□□□□□ -2.76
SSK2P53599 VPS20YMR077C 666 nt-2.19□□□□□ -2.76
SSK2P53599 YDR269CYDR269C 324 nt-2.2□□□□□ -2.76
SSK2P53599 SPC24YMR117C 642 nt-2.2□□□□□ -2.76
SSK2P53599 RUF20RUF20 443 nt-2.2□□□□□ -2.76
SSK2P53599 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-2.21□□□□□ -2.76
SSK2P53599 Q0142Q0142 177 nt-2.22□□□□□ -2.76
SSK2P53599 YPL261CYPL261C 309 nt-2.22□□□□□ -2.76
SSK2P53599 SCEIQ0160 708 nt-2.23□□□□□ -2.77
SSK2P53599 YER135CYER135C 393 nt-2.24□□□□□ -2.77
SSK2P53599 YPR092WYPR092W 306 nt-2.24□□□□□ -2.77
SSK2P53599 RSM18YER050C 417 nt-2.26□□□□□ -2.77
SSK2P53599 YOR366WYOR366W 354 nt-2.26□□□□□ -2.77
SSK2P53599 YDR290WYDR290W 330 nt-2.27□□□□□ -2.77
SSK2P53599 YGR228WYGR228W 345 nt-2.27□□□□□ -2.77
SSK2P53599 snR5snR5 204 nt-2.27□□□□□ -2.77
SSK2P53599 RDS3YPR094W 324 nt-2.28□□□□□ -2.77
SSK2P53599 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-2.29□□□□□ -2.78
SSK2P53599 CBS1YDL069C 690 nt-2.32□□□□□ -2.78
SSK2P53599 YOR170WYOR170W 306 nt-2.32□□□□□ -2.78
SSK2P53599 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-2.32□□□□□ -2.78
SSK2P53599 RPL22BYFL034C-A 369 nt-2.32□□□□□ -2.78
SSK2P53599 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-2.32□□□□□ -2.78
SSK2P53599 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-2.33□□□□□ -2.78
SSK2P53599 snR74snR74 88 nt-2.34□□□□□ -2.78
SSK2P53599 CUP1-1YHR053C 186 nt-2.34□□□□□ -2.78
SSK2P53599 CUP1-2YHR055C 186 nt-2.34□□□□□ -2.78
SSK2P53599 YJL086CYJL086C 369 nt-2.34□□□□□ -2.78
SSK2P53599 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-2.36□□□□□ -2.79
SSK2P53599 COX7YMR256C 183 nt-2.36□□□□□ -2.79
SSK2P53599 YGL052WYGL052W 306 nt-2.38□□□□□ -2.79
SSK2P53599 EAF6YJR082C 342 nt-2.38□□□□□ -2.79
SSK2P53599 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-2.38□□□□□ -2.79
SSK2P53599 PET20YPL159C 762 nt-2.38□□□□□ -2.79
SSK2P53599 SRB7YDR308C 423 nt-2.39□□□□□ -2.79
SSK2P53599 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-2.4□□□□□ -2.79
SSK2P53599 snR81snR81 201 nt-2.4□□□□□ -2.79
SSK2P53599 YGL015CYGL015C 393 nt-2.4□□□□□ -2.79
SSK2P53599 ACF4YJR083C 930 nt-2.44□□□□□ -2.8
SSK2P53599 SGF11YPL047W 300 nt-2.44□□□□□ -2.8
SSK2P53599 YDR366CYDR366C 399 nt-2.44□□□□□ -2.8
SSK2P53599 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-2.44□□□□□ -2.8
SSK2P53599 DFG10YIL049W 762 nt-2.44□□□□□ -2.8
SSK2P53599 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-2.44□□□□□ -2.8
SSK2P53599 snR72snR72 98 nt-2.47□□□□□ -2.8
SSK2P53599 IRC16YPR038W 360 nt-2.47□□□□□ -2.8
SSK2P53599 THG1YGR024C 714 nt-2.49□□□□□ -2.81
SSK2P53599 MND1YGL183C 660 nt-2.5□□□□□ -2.81
SSK2P53599 snR24snR24 89 nt-2.51□□□□□ -2.81
SSK2P53599 YKL202WYKL202W 582 nt-2.52□□□□□ -2.81
SSK2P53599 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt-2.52□□□□□ -2.81
SSK2P53599 CWC23YGL128C 852 nt-2.53□□□□□ -2.81
SSK2P53599 YHR125WYHR125W 306 nt-2.53□□□□□ -2.81
SSK2P53599 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-2.53□□□□□ -2.81
SSK2P53599 YPL229WYPL229W 621 nt-2.53□□□□□ -2.81
SSK2P53599 BNS1YGR230W 414 nt-2.53□□□□□ -2.82
SSK2P53599 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-2.55□□□□□ -2.82
SSK2P53599 SDH6YDR379C-A 240 nt-2.56□□□□□ -2.82
SSK2P53599 YER053C-AYER053C-A 114 nt-2.56□□□□□ -2.82
SSK2P53599 AIM29YKR074W 468 nt-2.57□□□□□ -2.82
SSK2P53599 YKL063CYKL063C 504 nt-2.58□□□□□ -2.82
SSK2P53599 VPS63YLR261C 327 nt-2.58□□□□□ -2.82
SSK2P53599 YNL058CYNL058C 951 nt-2.58□□□□□ -2.82
SSK2P53599 JLP2YMR132C 627 nt-2.59□□□□□ -2.82
SSK2P53599 YBR285WYBR285W 435 nt-2.59□□□□□ -2.82
SSK2P53599 YGL239CYGL239C 315 nt-2.61□□□□□ -2.83
SSK2P53599 snR51snR51 107 nt-2.61□□□□□ -2.83
SSK2P53599 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-2.62□□□□□ -2.83
SSK2P53599 YPT6YLR262C 648 nt-2.62□□□□□ -2.83
SSK2P53599 POP7YBR167C 423 nt-2.62□□□□□ -2.83
SSK2P53599 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-2.63□□□□□ -2.83
SSK2P53599 YOL106WYOL106W 354 nt-2.63□□□□□ -2.83
SSK2P53599 snR77snR77 88 nt-2.64□□□□□ -2.83
SSK2P53599 YKL044WYKL044W 321 nt-2.64□□□□□ -2.83
SSK2P53599 ZEO1YOL109W 342 nt-2.66□□□□□ -2.83
SSK2P53599 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-2.66□□□□□ -2.84
SSK2P53599 MATALPHA2YCR039C 633 nt-2.66□□□□□ -2.84
SSK2P53599 HMRA2YCR096C 360 nt-2.66□□□□□ -2.84
SSK2P53599 YER188C-AYER188C-A 300 nt-2.67□□□□□ -2.84
SSK2P53599 snR39BsnR39B 96 nt-2.67□□□□□ -2.84
SSK2P53599 YOR121CYOR121C 306 nt-2.69□□□□□ -2.84
SSK2P53599 YGR025WYGR025W 303 nt-2.7□□□□□ -2.84
SSK2P53599 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-2.71□□□□□ -2.84
SSK2P53599 FYV7YLR068W 456 nt-2.71□□□□□ -2.84
SSK2P53599 YNL205CYNL205C 423 nt-2.74□□□□□ -2.85
SSK2P53599 snR59snR59 78 nt-2.74□□□□□ -2.85
SSK2P53599 LSM4YER112W 564 nt-2.74□□□□□ -2.85
SSK2P53599 CSE2YNR010W 450 nt-2.75□□□□□ -2.85
SSK2P53599 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-2.76□□□□□ -2.85
SSK2P53599 YAR029WYAR029W 225 nt-2.77□□□□□ -2.85
SSK2P53599 ILM1YJR118C 612 nt-2.78□□□□□ -2.85
SSK2P53599 YJR087WYJR087W 351 nt-2.79□□□□□ -2.86
SSK2P53599 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-2.81□□□□□ -2.86
SSK2P53599 YOR364WYOR364W 369 nt-2.82□□□□□ -2.86
SSK2P53599 YLR456WYLR456W 615 nt-2.83□□□□□ -2.86
SSK2P53599 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-2.85□□□□□ -2.87
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