Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 YFL063WYFL063W 456 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN9P53437 ALG13YGL047W 609 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN9P53437 RPS27BYHR021C 249 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN9P53437 RPL39YJL189W 156 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN9P53437 YPL044CYPL044C 549 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN9P53437 YER097WYER097W 330 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN9P53437 YOR282WYOR282W 321 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN9P53437 SGF11YPL047W 300 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN9P53437 MCM10YIL150C 1716 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN9P53437 COG8YML071C 1824 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN9P53437 PAA1YDR071C 576 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN9P53437 CMC4YMR194C-B 222 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN9P53437 DOP1YDR141C 5097 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN9P53437 INA22YIR024C 651 nt0.84□□□□□ -2.27
RRN9P53437 STE5YDR103W 2754 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN9P53437 NOP9YJL010C 2001 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN9P53437 YNL211CYNL211C 261 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN9P53437 PAU24YBR301W 363 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN9P53437 YNL028WYNL028W 318 nt0.8□□□□□ -2.28
RRN9P53437 BFR2YDR299W 1605 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN9P53437 RPL26BYGR034W 384 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN9P53437 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.78□□□□□ -2.28
RRN9P53437 YPR117WYPR117W 7470 nt0.77□□□□□ -2.29
RRN9P53437 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.77□□□□□ -2.29
RRN9P53437 RKR1YMR247C 4689 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN9P53437 PMP1YCR024C-A 123 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN9P53437 Q0142Q0142 177 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN9P53437 RAD61YDR014W 1944 nt0.74□□□□□ -2.29
RRN9P53437 NPR2YEL062W 1848 nt0.74□□□□□ -2.29
RRN9P53437 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.74□□□□□ -2.29
RRN9P53437 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.74□□□□□ -2.29
RRN9P53437 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN9P53437 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN9P53437 YGR069WYGR069W 336 nt0.71□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.71□□□□□ -2.3
RRN9P53437 SEC1YDR164C 2175 nt0.7□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.7□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN9P53437 SEC8YPR055W 3198 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN9P53437 PRP16YKR086W 3216 nt0.68□□□□□ -2.3
RRN9P53437 MYO1YHR023W 5787 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YNL146WYNL146W 303 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YOR015WYOR015W 360 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YPR092WYPR092W 306 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN9P53437 snR190snR190 190 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN9P53437 CHS6YJL099W 2241 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YML002WYML002W 2214 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN9P53437 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN9P53437 snR65snR65 100 nt0.65□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YGL052WYGL052W 306 nt0.65□□□□□ -2.31
RRN9P53437 COX5BYIL111W 456 nt0.65□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.65□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.65□□□□□ -2.31
RRN9P53437 PAM16YJL104W 450 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN9P53437 ASE1YOR058C 2658 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN9P53437 COY1YKL179C 2040 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YLR282CYLR282C 342 nt0.62□□□□□ -2.31
RRN9P53437 UBP3YER151C 2739 nt0.62□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.61□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YDL073WYDL073W 2955 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 BLI1YKL061W 342 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 FYV10YIL097W 1551 nt0.6□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.59□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.59□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.59□□□□□ -2.31
RRN9P53437 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.59□□□□□ -2.31
RRN9P53437 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.32
RRN9P53437 snR74snR74 88 nt0.58□□□□□ -2.32
RRN9P53437 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.57□□□□□ -2.32
RRN9P53437 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.57□□□□□ -2.32
RRN9P53437 PRP5YBR237W 2550 nt0.55□□□□□ -2.32
RRN9P53437 OST4YDL232W 111 nt0.55□□□□□ -2.32
RRN9P53437 PRP42YDR235W 1635 nt0.55□□□□□ -2.32
RRN9P53437 PET111YMR257C 2403 nt0.55□□□□□ -2.32
RRN9P53437 ULI1YFR026C 510 nt0.54□□□□□ -2.32
RRN9P53437 RPS30BYOR182C 192 nt0.54□□□□□ -2.32
RRN9P53437 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.53□□□□□ -2.32
RRN9P53437 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.53□□□□□ -2.32
RRN9P53437 snR49snR49 165 nt0.53□□□□□ -2.32
RRN9P53437 BEM3YPL115C 3387 nt0.53□□□□□ -2.33
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