Protein–RNA interactions for Protein: P53158

KXD1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit KXD1, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KXD1P53158 YML002WYML002W 2214 nt2.58□□□□□ -2
KXD1P53158 SYH1YPL105C 2550 nt2.57□□□□□ -2
KXD1P53158 SSD1YDR293C 3753 nt2.57□□□□□ -2
KXD1P53158 SAP1YER047C 2694 nt2.57□□□□□ -2
KXD1P53158 GCN2YDR283C 4980 nt2.57□□□□□ -2
KXD1P53158 ALY2YJL084C 3141 nt2.57□□□□□ -2
KXD1P53158 RSE1YML049C 4086 nt2.57□□□□□ -2
KXD1P53158 PSD2YGR170W 3417 nt2.56□□□□□ -2
KXD1P53158 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.56□□□□□ -2
KXD1P53158 RPM2YML091C 3609 nt2.56□□□□□ -2
KXD1P53158 TDA9YML081W 3756 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 NUT1YGL151W 3399 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 CYR1YJL005W 6081 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 CHC1YGL206C 4962 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 AXL1YPR122W 3627 nt2.55□□□□□ -2
KXD1P53158 INO80YGL150C 4470 nt2.54□□□□□ -2
KXD1P53158 PAN2YGL094C 3348 nt2.54□□□□□ -2
KXD1P53158 YPR097WYPR097W 3222 nt2.54□□□□□ -2
KXD1P53158 HIR3YJR140C 4947 nt2.54□□□□□ -2
KXD1P53158 RGA1YOR127W 3024 nt2.54□□□□□ -2
KXD1P53158 HSL1YKL101W 4557 nt2.53□□□□□ -2
KXD1P53158 SEC21YNL287W 2808 nt2.53□□□□□ -2
KXD1P53158 SPO24YPR036W-A 204 nt2.53□□□□□ -2
KXD1P53158 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.52□□□□□ -2.01
KXD1P53158 FKS3YMR306W 5358 nt2.52□□□□□ -2.01
KXD1P53158 IRE1YHR079C 3348 nt2.52□□□□□ -2.01
KXD1P53158 SIR4YDR227W 4077 nt2.51□□□□□ -2.01
KXD1P53158 YDL073WYDL073W 2955 nt2.51□□□□□ -2.01
KXD1P53158 snR70snR70 164 nt2.51□□□□□ -2.01
KXD1P53158 CDC60YPL160W 3273 nt2.51□□□□□ -2.01
KXD1P53158 ORC3YLL004W 1851 nt2.5□□□□□ -2.01
KXD1P53158 ASE1YOR058C 2658 nt2.5□□□□□ -2.01
KXD1P53158 TIM9YEL020W-A 264 nt2.5□□□□□ -2.01
KXD1P53158 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.5□□□□□ -2.01
KXD1P53158 LCL1YPL056C 306 nt2.5□□□□□ -2.01
KXD1P53158 snR64snR64 101 nt2.49□□□□□ -2.01
KXD1P53158 SVL3YPL032C 2478 nt2.49□□□□□ -2.01
KXD1P53158 BCK1YJL095W 4437 nt2.49□□□□□ -2.01
KXD1P53158 NUM1YDR150W 8247 nt2.49□□□□□ -2.01
KXD1P53158 FYV10YIL097W 1551 nt2.49□□□□□ -2.01
KXD1P53158 MYO2YOR326W 4725 nt2.49□□□□□ -2.01
KXD1P53158 GIP3YPL137C 3831 nt2.48□□□□□ -2.01
KXD1P53158 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
KXD1P53158 SFB2YNL049C 2631 nt2.48□□□□□ -2.01
KXD1P53158 UFD4YKL010C 4452 nt2.48□□□□□ -2.01
KXD1P53158 TOR1YJR066W 7413 nt2.47□□□□□ -2.01
KXD1P53158 TOF1YNL273W 3717 nt2.47□□□□□ -2.01
KXD1P53158 PET309YLR067C 2898 nt2.47□□□□□ -2.01
KXD1P53158 snR47snR47 99 nt2.46□□□□□ -2.02
KXD1P53158 YEF3YLR249W 3135 nt2.46□□□□□ -2.02
KXD1P53158 RAV1YJR033C 4074 nt2.46□□□□□ -2.02
KXD1P53158 ESC1YMR219W 4977 nt2.44□□□□□ -2.02
KXD1P53158 WAR1YML076C 2835 nt2.43□□□□□ -2.02
KXD1P53158 DNA2YHR164C 4569 nt2.43□□□□□ -2.02
KXD1P53158 YAR009CYAR009C 3591 nt2.43□□□□□ -2.02
KXD1P53158 UBP3YER151C 2739 nt2.41□□□□□ -2.02
KXD1P53158 BNR1YIL159W 4128 nt2.4□□□□□ -2.02
KXD1P53158 MMS4YBR098W 2076 nt2.4□□□□□ -2.02
KXD1P53158 TRA1YHR099W 11235 nt2.39□□□□□ -2.03
KXD1P53158 YLR419WYLR419W 4308 nt2.39□□□□□ -2.03
KXD1P53158 AZF1YOR113W 2745 nt2.39□□□□□ -2.03
KXD1P53158 RPL26BYGR034W 384 nt2.39□□□□□ -2.03
KXD1P53158 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt2.39□□□□□ -2.03
KXD1P53158 PDR1YGL013C 3207 nt2.39□□□□□ -2.03
KXD1P53158 ROM2YLR371W 4071 nt2.39□□□□□ -2.03
KXD1P53158 MSH6YDR097C 3729 nt2.39□□□□□ -2.03
KXD1P53158 PDR11YIL013C 4236 nt2.38□□□□□ -2.03
KXD1P53158 NOP9YJL010C 2001 nt2.38□□□□□ -2.03
KXD1P53158 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.38□□□□□ -2.03
KXD1P53158 UTP21YLR409C 2820 nt2.38□□□□□ -2.03
KXD1P53158 GYP5YPL249C 2685 nt2.38□□□□□ -2.03
KXD1P53158 RTT101YJL047C 2529 nt2.38□□□□□ -2.03
KXD1P53158 SEC10YLR166C 2616 nt2.37□□□□□ -2.03
KXD1P53158 YOR055WYOR055W 435 nt2.37□□□□□ -2.03
KXD1P53158 snR190snR190 190 nt2.37□□□□□ -2.03
KXD1P53158 SAC3YDR159W 3906 nt2.36□□□□□ -2.03
KXD1P53158 snR50snR50 90 nt2.36□□□□□ -2.03
KXD1P53158 ARP8YOR141C 2646 nt2.35□□□□□ -2.03
KXD1P53158 EMC5YIL027C 426 nt2.34□□□□□ -2.03
KXD1P53158 RAD50YNL250W 3939 nt2.33□□□□□ -2.04
KXD1P53158 YCS4YLR272C 3531 nt2.33□□□□□ -2.04
KXD1P53158 NNF2YGR089W 2811 nt2.32□□□□□ -2.04
KXD1P53158 SMC1YFL008W 3678 nt2.3□□□□□ -2.04
KXD1P53158 YLR422WYLR422W 5799 nt2.3□□□□□ -2.04
KXD1P53158 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.3□□□□□ -2.04
KXD1P53158 IRA2YOL081W 9240 nt2.3□□□□□ -2.04
KXD1P53158 PIK1YNL267W 3201 nt2.3□□□□□ -2.04
KXD1P53158 SLN1YIL147C 3663 nt2.3□□□□□ -2.04
KXD1P53158 KOG1YHR186C 4674 nt2.29□□□□□ -2.04
KXD1P53158 CHS1YNL192W 3396 nt2.29□□□□□ -2.04
KXD1P53158 SGS1YMR190C 4344 nt2.28□□□□□ -2.04
KXD1P53158 KIP1YBL063W 3336 nt2.28□□□□□ -2.04
KXD1P53158 snR14snR14 160 nt2.28□□□□□ -2.04
KXD1P53158 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.9 ms